[发明专利]与大豆抗疫病基因RpsZS18共分离的分子标记及其应用

摘要

本发明提供一种与大豆抗疫病基因RpsZS18共分离的分子标记ZCindel246000及其应用，所述标记位于大豆2号染色体的SSR标记ZCSSR33和ZCSSR46之间，且与基因RpsZS18的遗传距离为0cM。本发明以抗病品种早熟18为父本，感病品种Williams为母本，通过杂交和自交产生F₃群体作为作图群体，根据初定位结果，用该区间内公布的大豆SSR标记和利用大豆基因组序列开发新的SSR标记，对早熟18含有的抗病基因进行精细定位。抗病基因RpsZS18被定位在2号染色体的ZCSSR33(0.7cM)和ZCSSR46(2.8cM)之间，并与SSR标记Satt172共分离。根据新定位区间内的基因注释，预测RpsZS18候选基因，根据抗、感亲本预测的候选基因位点序列差异，开发Indel标记ZCindel24600，将该标记进行群体验证后发现其为共分离标记，该Indel标记可用于大豆抗疫病的辅助育种中。

主权项

1.与大豆抗疫病基因RpsZS18共分离的分子标记ZCindel246000，其特征在于，所述分子标记位于大豆2号染色体的SSR标记ZCSSR33和ZCSSR46之间，用于特异性PCR扩增分子标记ZCindel246000的引物对为：上游引物F:5’‑CAGATAGAGTTTTCCTACACAGG‑3’和下游引物R：5’‑AGTAGAAGCAAAGAGGGACT‑3’；扩增产物大小为279bp；其中，SSR标记ZCSSR33和ZCSSR46的信息如下：SSR标记ZCSSR33位于大豆2号染色体的起止位置为43410490～43410642bp，用于扩增标记ZCSSR33的引物为上游引物5’‑CATTATTTCTTGTGGGT‑3’A和下游引物5’‑TGACAACATAGAACCAAA‑3’，扩增产物大小为153bp；SSR标记ZCSSR46位于大豆2号染色体的起止位置为43522898～43523091bp‑3’，用于扩增标记ZCSSR46的引物为上游引物5’‑AAAGGGAGAAGCAAGTAAT‑3’和下游引物5’‑TCGCAAACAGTAAACACG‑3’，扩增产物大小为194bp。