[发明专利]遗传图谱的构建方法和装置

摘要

本发明公开了一种遗传图谱的构建方法和装置，该方法包括：接收分子标记数据和多个个体的测序数据；根据分子标记数据对多个个体的测序数据进行整合得到预设格式的第一基因型数据；根据第一基因型数据获取每个标记的标记缺失率、每个个体的个体标记缺失率和任意两个标记之间的物理距离中的一种或多种；根据标记缺失率、个体标记缺失率和任意两个标记之间的物理距离中的一种或多种对个体和/或标记进行筛选，以得到第二基因型数据；根据第二基因型数据构建遗传图谱。本发明实施例的遗传图谱的构建方法，免去人工操作，省时省力，并且提高了整理和筛选的准确率和效率，从而提高了构建遗传图谱的准确性和效率，为遗传图谱的构建提供了便利的条件。

主权项

1.一种遗传图谱的构建方法，其特征在于，包括：接收分子标记数据和多个个体的测序数据；根据所述分子标记数据对所述多个个体的测序数据进行整合得到预设格式的第一基因型数据；根据所述第一基因型数据获取每个标记的标记缺失率、每个个体的个体标记缺失率和任意两个标记之间的物理距离中的一种或多种；根据所述标记缺失率、所述个体标记缺失率和所述任意两个标记之间的物理距离中的一种或多种对个体和/或标记进行筛选，以得到第二基因型数据；根据所述第二基因型数据构建遗传图谱；其中，根据所述标记缺失率、所述个体标记缺失率和所述任意两个标记之间的物理距离中的一种或多种对个体和/或标记进行筛选，以得到第二基因型数据包括以下操作中的任意一种或一种以上：获取所述第一基因型数据中物理距离小于预设距离的标记A和标记B；如果所述标记A的标记缺失率大于所述标记B的标记缺失率，则将所述标记A对应的记录从所述第一基因型数据中移除；如果所述标记A的缺失率小于或等于所述标记B的标记缺失率，则将所述标记B对应的记录从所述第一基因型数据中移除；获取所述第一基因型数据中个体标记缺失率大于第一阈值的个体，并将所述个体标记缺失率大于第一阈值的个体对应的记录从所述第一基因型数据中移除；以及获取所述第一基因型数据中标记缺失率大于第二阈值的标记，并将所述标记缺失率大于第二阈值的标记对应的记录从所述第一基因型数据中移除。