[发明专利]一种快速筛选多倍体植物目的基因克隆产物的引物、方法有效
申请号: | 201410452747.0 | 申请日: | 2014-09-05 |
公开(公告)号: | CN104195249B | 公开(公告)日: | 2018-08-28 |
发明(设计)人: | 陈发棣;赵楠;陈素梅;蒋甲福;张飞;廖园 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 徐冬涛 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明属于生物技术领域,提供一种快速筛选多倍体植物目的基因克隆产物的引物、方法及二者在菊花上的应用以及该引物在试剂盒上的应用。快速筛选目的基因克隆产物的方法包括:(1)引物设计(2)基因克隆扩增(3)检测引物筛选基因克隆产物,确定克隆产物对应的基因是否为目的基因。本发明解决了现有技术中,筛选菊花等多倍体植物目的基因克隆产物过程复杂、效率低下的问题。通过本发明提供的检测引物,每增加1bp长度,筛选目的基因的准确性即提高4倍。例如检测引物长度为18bp,则在原基础上筛选度提高了418倍。检测引物为复杂基因组基因的分子克隆提供思路,大大提高了基因克隆的效率。 | ||
搜索关键词: | 一种 快速 筛选 多倍体 植物 目的 基因 克隆 产物 引物 方法 | ||
【主权项】:
1.一种快速筛选菊花目的基因克隆产物的引物,其特征在于:包括5’RACE反向扩增的引物,该引物包括反转录引物、特异性扩增引物、正、反向检测引物和接头引物,引物长度分别为16‑30 bp,Tm 55‑65℃,正向和反向检测引物相距100‑200 bp,检测引物在特异性扩增引物之一GSP5’‑3上游;反转录引物为:GSP5’‑1:如SEQ ID NO.5所示;特异性扩增引物为:GSP5’‑2:如SEQ ID NO.6所示GSP5’‑3:如SEQ ID NO.7所示;检测引物为:5’RACE JC‑F:如SEQ ID NO.3所示5’RACE JC‑R:如SEQ ID NO.4所示;接头引物为:AAP序列:GGCCACGCGTCGACTAGTACGGGIIGGGIIGGGIIG;AUAP序列:GGCCACGCGTCGACTAGTAC;包括3’RACE正向扩增的引物,该引物包括特异性扩增引物、正、反向检测引物和接头引物,引物长度分别为16‑30 bp,Tm 55‑65℃,正向和反向检测引物相距100‑200 bp,检测引物在特异性扩增引物之一GSP3’‑3下游;特异扩增引物为:GSP3’‑1:如SEQ ID NO.8所示GSP3’‑2:如SEQ ID NO.9所示GSP3’‑3:如SEQ ID NO.10所示;检测引物为:3’RACE JC‑F:如SEQ ID NO.11所示3’RACE JC‑R:如SEQ ID NO.12所示;接头引物为:AP:CTGATCTAGAGGTACCGGATCC;dT‑AP序列:CTGATCTAGAGGTACCGGATCCTTTTTTTTTTTTTTTT;包括中间片段进行扩增时的引物,该引物包括特异性扩增引物和正、反向检测引物,引物长度分别为16‑30 bp,Tm 55‑65℃,正向和反向检测引物相距100‑200 bp,正向检测引物在正向特异扩增引物的下游,反向检测引物在反向特异扩增引物的上游,正向特异性扩增引物与正向检测引物相距50‑100 bp,反向特异性扩增引物与反向检测引物相距50‑100 bp;特异扩增引物为:中间GSP‑F:如SEQ ID NO.13所示中间GSP‑R:如SEQ ID NO.14所示;检测引物为:中间JC‑F:如SEQ ID NO.15所示中间JC‑R:如SEQ ID NO.16所示。
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