[发明专利]浮游动物rrnL基因扩增引物及其筛选方法和应用及应用方法有效

专利信息
申请号: 201410736863.5 申请日: 2014-12-05
公开(公告)号: CN104404154B 公开(公告)日: 2018-01-09
发明(设计)人: 张效伟;杨江华 申请(专利权)人: 南京大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;G06F19/22
代理公司: 南京知识律师事务所32207 代理人: 蒋海军
地址: 210023 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种浮游动物rrnL基因扩增引物及其筛选方法和应用及应用方法,属于生物技术领域。本发明依据常见浮游动物rrnL基因序列设计了9条PCR扩增引物,包括5条上游引物和4条下游引物,该引物对浮游动物覆盖度广、扩增效率高,其PCR产物兼容高通量测序平台,将上游引物和下游引物两两组合可以扩增出长度为190bp至390bp的产物,这种多引物组合的方法可以降低非特异性扩增,提高PCR成功率,可广泛用作Barcode序列进行物种鉴定、生物多样性分析等研究。
搜索关键词: 浮游动物 rrnl 基因 扩增 引物 及其 筛选 方法 应用
【主权项】:
浮游动物rrnL基因扩增引物,其特征在于:包括5条上游引物和4条下游引物,所述的5条上游引物分别为ZoorrnL_80F1:GACTGTGCTAAGGTAGCATAAT、ZoorrnL_80F2:GACTGTGCTAAGGTAGCGTGAT、ZoorrnL_200F1:GACGATAAGACCCTATGAAGCT、ZoorrnL_200F2:GACGATCAGACCCTTTGGAGCT、ZoorrnL_200F3:GACGAGAAGACCCCA TAAAACT;所述的4条下游引物分别为ZoorrnL_320R1:GCTGTTATCCCTAGGG TAACTT、ZoorrnL_320R2:CCTGTTATCCCCAAAGTAGCTT、ZoorrnL_400R1:TAATCCAACATCGAG GTCGCA、ZoorrnL_400R2:TAATCCAACATCGAGGT AGTA。
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