[发明专利]一种以烟草花叶病毒RNA解旋酶为靶标的抗病毒药物虚拟筛选方法在审
| 申请号： | 201410848300.5 | 申请日： | 2014-12-31 |
| 公开（公告）号： | CN104504301A | 公开（公告）日： | 2015-04-08 |
| 发明（设计）人： | 杨松;周青;郑玉涛;叶意强;赵远超;陈玉婷;胡德禹;薛伟;吴志兵 | 申请（专利权）人： | 贵州大学 |
| 主分类号： | G06F19/16 | 分类号： | G06F19/16 |
| 代理公司： | 贵阳东圣专利商标事务有限公司52002 | 代理人： | 徐逸心;袁庆云 |
| 地址： | 550025贵州省贵*** | 国省代码： | 贵州;52 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种以烟草花叶病毒RNA解旋酶为靶标的抗烟草花叶病毒药物的虚拟筛选方法，同时通过分子模拟软件确定用于虚拟筛选的解旋酶结合ATP时的活性构象的三维结构。该方法可用于具有防治烟草花叶病毒活性的化合物的快速筛选。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 烟草 花叶 病毒 rna 解旋酶 靶标 抗病毒 药物 虚拟 筛选 方法 | ||
【主权项】：
一种以烟草花叶病毒RNA解旋酶为靶标的抗病毒药物的虚拟筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：(1) 通过分子模拟软件确定解旋酶结合三磷酸腺苷ATP时的活性构象的三维结构数据；(2) 采用分子对接软件，依据活性位点的氨基酸残基，确定分子对接的活性中心，设定活性口袋；(3) 对小分子配体进行筛选，建立对接用小分子配体数据库；(4) 根据设定的活性口袋，利用分子对接软件，将对接用小分子配体数据库中的小分子配体与活性口袋一一进行对接；(5) 根据对接结果的排序，进行综合评价，初步确定具有抗烟草花叶病毒效果的候选化合物。
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