[发明专利]一种细菌耐药性筛查PCR芯片

摘要

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种细菌耐药性筛查PCR芯片，包括集成化PCR载体和190对(380个)分别用于扩增与细菌耐药相关的基因的扩增引物对序列。本发明的有益效果在于提供了一种细菌耐药性PCR芯片，采用实时荧光PCR技术一次检测170种不同类别的耐药性因的190个靶点，无须细菌分离、培养，只需2小时即可快速、准确、灵敏地筛查复合样本中的细菌耐药性基因。

主权项

一种细菌耐药性筛查PCR芯片，包括PCR载体及分别用于扩增与细菌耐药相关的基因的扩增引物对，所述与细菌耐药相关的基因包括：氨基糖苷乙酰转移酶相关基因：aacA，aacA1，aacA4，aacA7，aacA29b，aacC1，aacC2，aacC3，aacC4，aac(3)‑Id；氨基糖苷腺苷转移酶相关基因：aadA4，aadA7，aadA9，aadA10，aadA12，aadD；氨基糖苷磷酸转移酶相关基因：aph，aphA，aphA‑3，aphA‑6，aphA‑7，aph2，aph(29)‑Ib，strA；β内酰胺酶相关基因：ctx‑m4，ctx‑m26，ctx‑m27，ctx‑m32，ges‑3，kpc‑3，per‑1，per‑2，shv‑34，blaTEM‑1，blaTLA‑1，blaTLA‑2，imp‑2，imp‑5，imp‑9，imp‑13，imp‑16，vim‑4，vim‑7，ampC，cmy‑9，cmy‑13，blanps‑1，blanps‑2，oxa‑1，oxa‑2，oxa‑5，oxa‑9，oxa‑10，oxa‑12，oxa‑18，oxa‑20，oxa‑22，oxa‑27，oxa‑29，oxa‑40，oxa‑45，oxa‑46，oxa‑48，oxa‑50，oxa‑54，oxa‑55，oxa‑58，oxa‑60，oxa‑61，oxa‑75；氯霉素酰基转移酶相关基因：cat，cat2，catIII，catA，catB2，catB4，catB6，catB7，catB8，catB9，catP；氯霉素/氟洛芬转运蛋白相关基因：cmlA1，cmxA，fexA，floR；疏水性多肽相关基因：cmlB；五肽家族蛋白相关基因：qnrA3，qnrB1，qnrB4，qnr；rRNA腺嘌呤N6‑甲基转移酶相关基因：ermA，ermB，ermD，ermF，erm(TR)；酯酶相关基因：ereA2，ereB；MFS外输泵相关基因：mefA，mefE，mel；大环内酯29‑磷酸转移酶相关基因：mph(B)，mph(A)，mph，mphB，mph(BM)；水解酶相关基因：vgh(A)；链阳菌素B内酯酶相关基因：vgbB；ADP‑核糖基转移酶相关基因：arr2；四环素转运蛋白相关基因：tet(A)，tetA(C)，tetA(J)，tetBSR，tet(D)，tet(G)，tet(H)，tet(L)，tetA(Y)，tet(Z)，effJ，tet(V)，tet(K)，tet(30)，tet(33)，tet(38)；四环素失活蛋白相关基因：tet(37)，tet(X)；GTP关联延伸因子相关基因：tetB(P)，tet(M)，tet(O)，tet(S)，tet(W)；核糖体保护蛋白相关基因：tet(36)，tetQ，tet(T)；四环素阻遏蛋白相关基因：tetR(31)；四环素抵抗相关基因：tet(U)；转磷酸核糖基酶相关基因：tet(34)；二氢叶酸还原酶相关基因：dfrII，dfrV，dfrVI，dfrXII，dfr13，dfr16，dfr17，dfrA19，dfrB2，dfrD，dhfr，dhfR，dhfrI，dhfrVIII，dhfrIX，dhfrXV；二氢蝶酸合成酶相关基因：sulI，sulII，sulIII；小型多药外输泵相关基因：qacB，qacD，qacED1，qacF，qacF，qacG，qacG2，qacH；多药外输泵相关基因：acrB，acrD，mexB，mexD，mexF，mexI，mexY，orfll。