[发明专利]用于鉴定患者特定驱动突变物的方法和系统

摘要

提供了用于鉴定患者特定驱动突变物的方法。所提供的方法在癌症患者的生物样品中鉴定特定患者来源的与异常信号转导通路相关的标志物。

主权项

1.编码荧光易位报告物(FTR)基因的表达载体在制备用于鉴定癌症患者的生物样品中的一种或更多种患者特定驱动突变物的试剂盒中的用途，当所述试剂盒被使用时，包括以下步骤：a)从所述生物样品获得多种mRNA；b)由所述多种mRNA产生cDNA文库；c)使用与编码已知的信号转导蛋白的多核苷酸互补的一组引物扩增所述cDNA文库中的特定cDNA；d)形成所扩增的cDNA的单独的表达构建体，其中所述cDNA被可操作地连接至启动子；e)形成携带来自肿瘤的所扩增的cDNA的第一组表达构建体及相应的野生型cDNA的第二组表达构建体的可寻址阵列；从而提供在编码所述信号转导蛋白的多核苷酸中携带候选突变的表达构建体的可寻址阵列，所述可寻址阵列适合鉴定所述癌症患者的生物样品中的患者特定驱动突变物；(f)对于所述可寻址阵列中的每个位点，加入所述编码荧光易位报告物(FTR)基因的表达载体，所述荧光易位报告物(FTR)基因包含连接至特定报告物基因部分的靶基因部分；g)在促使所述第一组表达构建体和所述第二组表达构建体以及所述表达载体转染进入活的测定细胞的条件下，将所述活的测定细胞添加至每个位点；以及h)比较表达来自所述肿瘤的cDNA与表达其相应的野生型表达的cDNA的活的测定细胞中表达的FTR的至少一个属性；其中，表达源自所述癌症患者的生物样品的cDNA与表达相应的野生型cDNA的活的测定细胞之间的不同结果，用于鉴定所述生物样品中作为候选的患者特定驱动突变物的cDNA。