[发明专利]用于鱼类群落结构研究的环境DNA鉴定方法有效
| 申请号： | 201510005835.0 | 申请日： | 2015-01-06 |
| 公开（公告）号： | CN104531879B | 公开（公告）日： | 2017-02-22 |
| 发明（设计）人： | 刘其根;戴亮亮;赵良杰;刘军;胡忠军 | 申请（专利权）人： | 上海海洋大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 上海智信专利代理有限公司31002 | 代理人： | 王洁 |
| 地址： | 201306 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种用于鱼类群落结构研究的环境DNA鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤步骤(1)根据鱼类群落所在水域的大小，采集水样；步骤(2)将水样进行处理后，提取其中的总环境DNA；步骤(3)将总环境DNA采用核苷酸序列为SEQ ID NO1和SEQ ID NO2的16s rDNA序列作为通用引物进行PCR扩增，得到PCR产物；步骤(4)将PCR产物进行凝胶电泳，得到带有DNA的凝胶；步骤(5)将带有DNA的凝胶进行切胶克隆测序后通过GENBANK进行blast比对，以确定DNA是否为鱼类序列；步骤(6)确定DNA为鱼类序列后，采用二代测序技术对PCR产物的组成情况进行大规模分析，以确定环境中DNA的鱼群的组成和鱼类的群落结构。采用该方法十分简便高效，具有实用价值。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 鱼类 群落 结构 研究 环境 dna 鉴定 方法 | ||
【主权项】：
一种用于鱼类群落结构研究的环境DNA鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤(1)：根据鱼类群落所在水域的大小，采集水样；步骤(2)：将所述的水样进行处理后，提取其中的总环境DNA；步骤(3)：将所述的总环境DNA采用核苷酸序列为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2的16srDNA序列作为通用引物进行PCR扩增，得到PCR产物；步骤(4)：将所述的PCR产物进行凝胶电泳，得到带有DNA的凝胶；步骤(5)：将所述的带有DNA的凝胶进行切胶克隆测序后通过GENBANK进行blast比对，以确定所述的DNA是否为鱼类序列；步骤(6)：确定所述的DNA为鱼类序列后，采用二代测序技术对所述的PCR产物的组成情况进行大规模分析，以确定环境中DNA的鱼群的组成和鱼类的群落结构。
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