[发明专利]基于SSR基因型生成果树SSR分子身份证号码的方法在审

专利信息
申请号: 201510022778.7 申请日: 2015-01-16
公开(公告)号: CN104651495A 公开(公告)日: 2015-05-27
发明(设计)人: 薛华柏;李秀根;张慧蓉;杨健;王龙;王苏珂 申请(专利权)人: 中国农业科学院郑州果树研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京冠和权律师事务所 11399 代理人: 朱健
地址: 450009*** 国省代码: 河南;41
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摘要: 发明提供了一种基于SSR基因型生成果树SSR分子身份证号码的方法,所述方法包括如下步骤:筛选用于果树品种扩增的SSR引物,对果树品种进行PCR扩增;PCR扩增产物经电泳检测后,统计果树品种在各SSR位点的基因型,对各SSR位点的所有基因型按升序排列后赋值,没有缺失基因型记为00,其余按顺序从01向99编号,再以此为标准将各品种在各SSR位点的基因型编号按一定的SSR位点顺序进行串联,从而形成果树品种SSR分子身份证号码。本方法充分考虑到了选择、突变、漂变等因素造成的各SSR位点等位基因频率的差异。
搜索关键词: 基于 ssr 基因型 生成 果树 分子 身份证号码 方法
【主权项】:
一种基于SSR基因型生成果树SSR分子身份证号码的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:筛选用于果树品种扩增的SSR引物,对果树品种进行PCR扩增;PCR扩增产物经电泳检测后,统计果树品种在各SSR位点的基因型;将各SSR位点的基因型按升序进行排序,并为每个SSR位点的基因型设置2位字符编号,所述基因型编号依次按照升序方式进行赋值;将果树品种对应的各SSR位点的基因型编号按照预定的SSR位点顺序串联,从而生成SSR分子身份证号码。
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