[发明专利]一种GelGreen染料在氯化铯密度梯度混合液中对DNA染色的方法有效

专利信息
申请号: 201510205804.X 申请日: 2015-04-27
公开(公告)号: CN104762407B 公开(公告)日: 2017-08-22
发明(设计)人: 高景峰;潘凯玲;樊晓燕;司春英;李洪禹;李婷;孙丽欣 申请(专利权)人: 北京工业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京汇信合知识产权代理有限公司11335 代理人: 陈圣清
地址: 100124 *** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明涉及一种GelGreen染料在氯化铯密度梯度混合液中对DNA染色的方法,属于分子生物学技术领域。所述方法包括以下步骤步骤1,采集环境样品并提取环境总DNA;步骤2,配制环境总DNA‑氯化铯混合液,并加入GelGreen染料;步骤3,将加入所述GelGreen染料的混合液进行超高速离心,得到密度梯度混合液;步骤4,将所述密度梯度混合液在激发波长为488nm的荧光透射仪的照射下进行分层,用注射器抽取相应层的密度梯度混合液;步骤5,对各层密度梯度混合液中的DNA进行细菌16S rRNA基因实时荧光定量PCR分析。本发明基于GelGreen染料在氯化铯密度梯度混合液中对DNA染色,大大提高了环境DNA在超高速密度梯度离心后的氯化铯密度梯度混合液中的检测灵敏度。
搜索关键词: 一种 gelgreen 染料 氯化铯 密度 梯度 混合液 dna 染色 方法
【主权项】:
一种GelGreen染料在氯化铯密度梯度混合液中对DNA染色的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1,采集环境样品,用土壤DNA提取试剂盒提取环境总DNA;步骤2,配制环境总DNA‑氯化铯混合液,并加入GelGreen染料;其中,所述的环境总DNA‑氯化铯混合液为:将环境总DNA与TE缓冲液或GB缓冲液配制成混合液,加入CsCl固体,涡旋混匀后再加入1g/mL的CsCl溶液和所述GelGreen染料,再将所述环境总DNA‑氯化铯混合液的浮力密度调节为1.72g/mL;所述混合液中GelGreen染料的浓度为15X;步骤3,将加入所述GelGreen染料的混合液进行超高速离心,得到密度梯度混合液;步骤4,在激发波长为488nm的荧光透射仪的照射下,鉴定DNA在所述密度梯度混合液中的位置,并用注射器对相应的密度梯度混合液进行分层、回收;其中,DNA的检出限为0.1μg,DNA用量为0.5μg时,目标条带清晰;步骤5,对各层密度梯度混合液中的DNA进行细菌16S rRNA基因实时荧光定量PCR分析。
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