[发明专利]一种模块化组装的蛋白质结构模型

摘要

本发明公开了一种模块化组装的蛋白质结构模型，由通用模块(肽平面模块)和氨基酸特征模块(α碳原子和侧链模块)依次重复连接而来，并分别在两端连接氨基模块和羧基模块，即：氨基模块‑氨基酸特征模块1‑通用模块1‑氨基酸特征模块2‑通用模块2……氨基酸特征模块n‑羧基模块。本发明模块以肽平面和α碳原子为基本结构模块，构筑可以准确展示蛋白质一级结构、二级结构、三级结构和四级结构等空间构型的模型，利于模型的标准化生产制造和有利于学生的理解、及在科研上的应用。

主权项

一种模块化组装的蛋白质结构模型，其特征在于：由通用模块和氨基酸特征模块依次重复连接而来，并分别在两端连接氨基模块和羧基模块，即：氨基模块‑氨基酸特征模块1‑通用模块1‑氨基酸特征模块2‑通用模块2……氨基酸特征模块n‑羧基模块；所述的通用模块是代表肽平面中羰基与氨基形成的酰胺平面结构组合模型，其结构如式I所示：其中L1、L2、L3、L4、L5表示与相应原子相连的键，O、C、N、H原子及键L1、L2、L3、L4、L5用四方形平面上的图示方法或代表原子和键的立体模型表示，L4、L5是可选结构；所述的氨基酸特征模块是指氨基酸α碳原子及其上连接的氢原子、侧链组合形成的结构，所述侧链组合上标记出该氨基酸的名称或者连接该氨基酸侧链其余部分的结构模型，其结构如式II所示：其中aa表示侧链组合；与C原子连接的键L6、L7、L8、L9呈四面体结构；虚线L8、L9表示备选结构；所述的氨基模块表示NH₂‑基团的结构模型，该模块是N原子、H原子及化学键模型组成的固定结构或组装结构；所述的羧基模块表示‑COOH基团的结构模型，该模块是C原子、O原子、H原子及化学键模型组成的固定结构或组装结构。