[发明专利]用以检测染色体的非整倍性的方法及其非瞬时机器可读介质有效
申请号: | 201510287937.6 | 申请日: | 2015-05-29 |
公开(公告)号: | CN105303067B | 公开(公告)日: | 2018-03-02 |
发明(设计)人: | 詹佳翰 | 申请(专利权)人: | 有劲生物科技股份有限公司 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 北京律诚同业知识产权代理有限公司11006 | 代理人: | 徐金国 |
地址: | 中国台湾新北市*** | 国省代码: | 台湾;71 |
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摘要: | 本发明涉及一种用以检测关于目标核酸区域的染色体的非整倍性的方法,其包含下列步骤。取得参照数据库。根据参照数据库确定至少一正规化因子。根据该参照数据库确定截止值。通过测序平台测序受试生物样本,以得到受试生物样本的目标序列的数量。受试生物样本的目标序列源自于目标核酸区域。以已正规化因子,正规化受试生物样本的目标序列的数量,然后与截止值比对。根据比对,判定胎儿中关于目标核酸区域的染色体的非整倍性是否呈现。 | ||
搜索关键词: | 用以 检测 染色体 非整倍性 方法 及其 瞬时 机器 可读 介质 | ||
【主权项】:
一种用以检测关于目标核酸区域的染色体的非整倍性的方法,所述方法包含:取得一参照数据库,其中所述参照数据库通过测序平台测序多个参照生物样本而建立;根据所述参照数据库确定至少一正规化因子,所述确定所述正规化因子包含:确定每一所述参照生物样本的多个目标序列的数量,其中每一所述参照生物样本的所述目标序列源自于所述目标核酸区域;确定每一所述参照生物样本的多个关联序列的数量,其中所述参照生物样本的所述关联序列的所述数量与所述参照生物样本的所述目标序列的所述数量呈线性相关,且每一所述参照生物样本的所述关联序列源自于关联核酸区域;以及根据所述参照生物样本的所述目标序列的所述数量以及所述参照生物样本的所述关联序列的所述数量,确定所述正规化因子;根据所述参照数据库确定一截止值;通过所述测序平台测序受试生物样本,以得到所述受试生物样本的多个目标序列的数量,其中所述受试生物样本从孕妇上取得,且所述受试生物样本具有所述孕妇及所述孕妇的胎儿的核酸分子,且所述受试生物样本的所述目标序列源自于所述目标核酸区域;以所述正规化因子正规化所述受试生物样本的所述目标序列的所述数量;比对所述受试生物样本的所述目标序列的所述已正规化的数量与所述截止值;以及根据所述比对,判定所述胎儿中关于所述目标核酸区域的所述染色体的非整倍性是否呈现。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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