[发明专利]暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记

摘要

本发明涉及暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记，属DNA分子标记技术领域。本发明在已经获得其基因组数据的基础之上，利用常规的生物信息学方法，在基因组水平上检测其SSR的分布，进行引物设计，利用来自西双版纳地区的暗褐网柄牛肝菌样品，选取部分引物进行初筛、复筛后，得到15个具有多态性的SSR分子标记，其编号为PP50097、PP64100、PP32087、PP85099、PP80085、PP56123、PP76127、PP57130、PP39117、PP60130、PP93120、PP23157、PP45160、PP30156、PP48147。本发明的有益效果在于暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记，建立技术体系，弥补其特异性分子标记的空白，为暗褐网柄牛肝菌遗传多样性，群体遗传学及种质鉴定研究提供有力的研究工具。

主权项

暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记，其特征在于暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记包括15个具有多态性的SSR分子标记，其编号为： PP50097、PP64100、PP32087、PP85099、PP80085、PP56123、PP76127、PP57130、PP39117、PP60130、PP93120、PP23157、PP45160、PP30156、PP48147；其中：上述SSR分子标记的核苷酸序列分别为：PP50097，由SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列组成：PP64100，由SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列组成：PP32087，由SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列组成：PP85099，由SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列组成：PP80085，由SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列组成：PP56123，由SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列组成：PP76127，由SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列组成：PP57130，由SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列组成：PP39117，由SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列组成：PP60130，由SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列组成：PP93120，由SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列组成：PP23157，由SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列组成：PP45160，由SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列组成：PP30156，由SEQ ID NO:14所示的核苷酸序列组成：PP48147，由SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列组成：上述SSR分子标记的引物序列分别为：PP50097‑F：ATACGACCCTGTGTACTGCCATTC ；PP50097‑R：AGTGCGATGAGTAAATTCGACGAC ；PP64100‑F：GAATTGAGTGCGTGTGTCATGAGT ；PP64100‑R：GTTCGATGGCATCACCAACAT ；PP32087‑F：GCACAGGTATTGTCATCAACTTGG ；PP32087‑R：GTCCATGTAACACTACCACCACCA ；PP85099‑F：TGAAAGACAGACCTCGGGATAGTC ；PP85099‑R：TTACTCCAGTGTGCTGTTCAAACC ；PP80085‑F：ACGACTACTACGACTACCACCGC ；PP80085‑R：TCATAGTCGTTATCGTTGTTCGTTG ；PP56123‑F：GTACGTATGCACAAGTAAGCGACG ；PP56123‑R：ATCTGATAACTTGAAACCCCAACG ；PP76127‑F：TGTTTGAACGTGCTAGATCGAGAG ；PP76127‑R：CCCTTCCTGGACTTGCATTATTAC ；PP57130‑F：ATATGGCCACCTTGTATCACCATC ；PP57130‑R：CTCAAGTGTGGGAGTTGCCTCTAT ；PP39117‑F：AGTCTTTACGCGCTTGTTGGATAC ；PP39117‑R：GGAGAGAAAATGGACTGACTTGGA ；PP60130‑F：CCTTCTTGCTCAGATTTTGGAGAA ；PP60130‑R：CCATCCTCATTATCTCGAGTCCC ；PP93120‑F：GGGACCAATGATGGAAATCAAATA ；PP93120‑R：TAAGGTCAATGAGATTGTTTCGCA ；PP23157‑F：AATGATCATGACCACGACGATG ；PP23157‑R：ACACTAATAGGAGTCGTCGTTCGC ；PP45160‑F：GTTACATCCTCTGGACTGGCATCT ；PP45160‑R：ATATCAGCTGTAAGGAGTGGCGTT ；PP30156‑F：TTAGCACATATTGCATAGGCATGG ；PP30156‑R：GAAGCACAATCCCGAAATAGATTG ；PP48147‑F：ATCATCATCATCATTCACAATGGG ；PP48147‑R：CATGAACAATGGTGACAACAACAA 。