[发明专利]疾病易感风险预测装置

摘要

本发明涉及生物信息学，提供了一种疾病易感风险预测方法及装置。本发明的疾病易感风险预测方法包括提供包含疾病的发病率数据、SNP位点基因型频率数据、针对每个疾病相关SNP位点的风险等位纯合基因型及杂合基因型的OR值数据的数据库；接收待测个体的信息；计算获得待测个体所感兴趣疾病的疾病综合易感风险数组；生成指定年龄范围的个体疾病综合易感风险动态变化曲线。本发明同时考虑个体遗传和环境两个方面的因素计算个体疾病易感性风险，计算结果更符合客观现实，获得的针对个体的疾病易感性风险年龄变化曲线，使得个体不仅能够获悉更为精确的即时疾病易感风险，同时也能够继续了解伴随年龄增长后各类疾病易感性变化的趋势。

主权项

一种疾病易感风险预测装置，其特征在于，包括：数据库单元(100)：用于提供包含疾病的发病率数据、SNP位点基因型频率数据、针对每个疾病相关SNP位点的风险等位纯合基因型及杂合基因型的OR值数据的数据库；其中，同一疾病的发病率数据依据地域、性别组成、年龄分布区段的不同组合进行区分，同一疾病相关SNP位点的各基因型的OR值数据依照地域、性别组成、年龄分布区段的不同组合进行区分，SNP位点基因型频率数据按地域不同进行区分；待测个体信息单元(200)：用于提供待测个体的地域信息、性别信息、SNP位点实测基因型信息；疾病综合易感风险数组计算单元(300)：与所述数据库单元(100)及待测个体信息单元(200)连接，用于针对待测个体感兴趣疾病，根据待测个体的地域信息、性别信息及SNP位点实测基因型信息，从数据库单元(100)中提取以下数据：相应地域相应性别组成在各年龄分布区段下的各感兴趣疾病的发病率数据，相应地域的各感兴趣疾病对应SNP位点基因型频率数据，以及相应地域相应性别组成在各年龄分布区段下的感兴趣疾病对应SNP位点的OR值数据；依据上述数据计算获得待测个体各感兴趣疾病的疾病综合易感风险数组，所述待测个体的疾病综合易感风险数组包括：与该待测个体基因型组成相同、相应地域、相应性别组成的各年龄区段的个体疾病综合易感风险值；疾病综合易感风险动态变化曲线单元(400)：与所述疾病综合易感风险数组计算单元(300)连接，用于依据各感兴趣疾病的个体疾病综合易感风险数组，使用LOESS回归拟合出各感兴趣疾病的个体疾病综合易感风险数组对应的疾病综合易感性风险计算函数，基于该函数，生成指定年龄范围的个体疾病综合易感风险动态变化曲线。