[发明专利]蛋白质组数据库及其应用

摘要

本发明公开了一种构建蛋白质组数据库的方法，该方法包括步骤接收多个蛋白序列；消除每个蛋白序列的起始氨基酸，获得相应的截断序列；建立数据表，以获得蛋白质组数据库，数据表包含多个记录，一个所述记录与一个所述截断序列对应，数据表包含多个字段，字段包括以下序列参数中的至少两种氨基酸丰度、序列长度、序列分子量、序列疏水性和序列等电点。本发明还公开一种蛋白质组数据库、蛋白质组数据库在蛋白质分组、检索和/或定位中的用途、一种定位蛋白的方法和系统。本发明的方法和/或蛋白质组数据库建立了蛋白的坐标系统，利于简单高效利用蛋白质大数据。

主权项

一种构建蛋白质组数据库的方法，其特征在于，包括以下步骤：接收多个蛋白序列；消除每个所述蛋白序列的起始氨基酸，获得相应的截断序列；建立数据表，以获得所述蛋白质组数据库，所述数据表包含多个记录，一个所述记录与一个所述截断序列对应，所述数据表包含多个字段，所述字段包括以下序列参数中的至少两种：氨基酸丰度、序列长度、序列分子量、序列疏水性和序列等电点，所述氨基酸丰度包括以下至少之一：Ala丰度、Cys丰度、Asp丰度、Glu丰度、Phe丰度、Gly丰度、His丰度、Ile丰度、Lys丰度、Leu丰度、Met丰度、Asn丰度、Pro丰度、Gln丰度、Arg丰度、Ser丰度、Thr丰度、Val丰度、Trp丰度和Tyr丰度。