[发明专利]一种稻属12个物种的基因组BAC同源区筛选方法在审

专利信息
申请号: 201510561317.7 申请日: 2015-09-07
公开(公告)号: CN105132552A 公开(公告)日: 2015-12-09
发明(设计)人: 张胜利;李东方;胡海燕;郝薇薇;赵俊杰;贺杰 申请(专利权)人: 河南科技学院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 453003 河南*** 国省代码: 河南;41
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摘要: 发明公开了一种稻属12个物种的基因组BAC同源区筛选方法。对包含二倍体、四倍体等不同基因组类型在内的亲缘关系较近的12个稻属物种开展MOC1所在基因组BAC同源区比较研究是了解稻属MOC1基因组区段进化的有力手段,并能为该重要性状基因的育种应用提供一定的理论参考。针对MOC1及其所在BAC同源区采用特殊设计的方案进行两轮southern杂交方法实现了MOC1所在稻属12个物种的同源区BAC的快速有效的筛选。本发明所介绍的方法解决了如何从整个稻属不同基因组类型的野生近缘种的基因组BAC文库中快速有效的进行同源序列区重叠部分尽可能长的基因组BAC筛选问题。
搜索关键词: 种稻 12 物种 基因组 bac 同源 筛选 方法
【主权项】:
一种稻属12个物种的基因组BAC同源区筛选方法,其特征在于:以粳稻日本晴基因组中已经克隆的分蘖控制基因MOC1为出发点,进行BAC文库的第一轮筛选;并根据粳稻日本晴基因组中MOC1的上下游基因分布情况,选取适当基因位点为探针,进行第二轮筛选,最终筛选到稻属12个野生近缘物种中MOC1同源区重叠部分(overlap)尽可能长的同源BAC,请求保护本发明所采用的筛选方法,所选取的两轮探针的位置及其引物序列。
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