[发明专利]一种sgRNA碱基错配靶位点文库及其应用有效

专利信息
申请号: 201510616396.7 申请日: 2015-09-25
公开(公告)号: CN105316322B 公开(公告)日: 2018-12-07
发明(设计)人: 杜权;郑婷;侯英子 申请(专利权)人: 北京大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/63;C12N15/66;C12Q1/68;C40B40/06;C40B40/02;C40B50/06
代理公司: 北京万象新悦知识产权代理有限公司 11360 代理人: 贾晓玲
地址: 100871*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种针对一个sgRNA分子的单碱基错配靶位点DNA文库、以及该DNA文库与载体连接产生的载体文库。本发明还提供了上述DNA文库/载体文库在检测sgRNA脱靶效应研究中的应用。
搜索关键词: 一种 sgrna 碱基 错配靶位点 文库 及其 应用
【主权项】:
1.一种针对一个sgRNA序列的cDNA文库的构建方法,其特征在于包括以下步骤:(1)获得一个sgRNA分子的序列;(2)获得针对步骤(1)所述sgRNA分子种子区的所有可能的单碱基错配的靶位点片段;当所述单碱基错配靶位点片段的转录产物与sgRNA片段互补配对时,在sgRNA分子种子区存在一个碱基的错配;(3)将与所述sgRNA分子完全匹配的靶位点序列片段、以及步骤(2)中获得的与所述sgRNA序列存在单碱基错配的靶位点序列片段,连接到报告基因载体系统中。
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