[发明专利]检测多种新生儿遗传代谢病致病基因的引物及试剂盒

摘要

本发明公开了一种用于新生儿遗传代谢疾病基因体外定性检测的引物的设计方式，包括如下步骤：1)、获得遗传病相关的致病基因信息：通过OMIM数据库获得多种遗传性疾病相关的致病基因信息，包括基因位置信息、突变位点信息，然后根据得到的基因信息从NCBI数据库得到相关基因的外显子及内含子信息；2)、针对相关基因设计引物：对于每个基因的外显子及外显子内含子结合区域设计对应的特异性引物F1和R1。本发明还同时公开了综合征型耳聋的第一轮PCR引物序列表、G6PD基因的第一轮PCR引物序列表、SLC12A3基因第一轮PCR引物序列表。本发明能用于检测22种常见新生儿遗传病相关的基因。

主权项

1.用于新生儿遗传代谢疾病基因体外定性检测的引物的设计方式，其特征是包括如下步骤：1)、获得遗传病相关的致病基因信息：通过OMIM数据库获得多种遗传性疾病相关的致病基因信息，包括基因位置信息、突变位点信息，然后根据得到的基因信息从NCBI数据库得到相关基因的外显子及内含子信息；2)、针对相关基因设计引物：对于每个基因的外显子及外显子内含子结合区域设计对应的特异性引物F1和R1，设计原则为：每个外显子外延5bp，以保证将外显子内含子结合区域包含在内；引物序列区保守，即不存在突变或SNP，Tm值均一，Tm值的差异在5℃之内；扩增产物至少有10bp的重叠区；在每对引物前加上一段自行设计的序列A1和A2以及一段6个碱基的识别序列，用以二代测序结果的识别；A1和A2的序列如下：A1(5’‑3’)：TCTTTCCCTACCGACGCTCTTCCGATCTA2(5’‑3’)：GTGACTGGAGTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT识别序列有12个，分别为ATCACG，TTAGGC，ACAGTG，TGACCA，GCCAAT，CAGATC，ACTTGA，ATCACG，TAGCTT，GGCTAC，CTTGTA，GATCAG，每段识别序列可随机加到F1和R1中，F1和R1中识别序列的组合方式可以作为测序结果中样品和基因的识别信号；所得的用于新生儿遗传代谢疾病基因体外定性检测的引物，如表1～表3中的至少1个表格所述；综合征型耳聋的第一轮PCR引物序列表如下表1；G6PD基因的第一轮PCR引物序列表如下表2；SLC12A3基因第一轮PCR引物序列表如下表3；表1表2表3