[发明专利]一种快速检测土壤中病残体携带TMV方法在审

专利信息
申请号: 201510737364.2 申请日: 2015-11-03
公开(公告)号: CN105296626A 公开(公告)日: 2016-02-03
发明(设计)人: 刘世超;孙现超;许博文;彭浩然;朱虹;青玲 申请(专利权)人: 西南大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 代理人: 汤东凤
地址: 400715*** 国省代码: 重庆;85
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摘要: 发明公开了一种快速检测土壤中病残体携带TMV方法,包括土壤中病残体TMV病毒总RNA提取、逆转录制备cDNA模板、LAMP技术体系的建立与优化、电泳检测、特异性与灵敏度检验、样品检测。通过对E.Z.N.A.TM Soil RNA Kit及逆转录体系的改良,LAMP中dNTPmix、MgSO4、buffer、BstDNA ploymerase、cDNA的用量、反应时间,反应温度等条件进行优化,得到检测烟田土壤中病残体TMV的LAMP技术的最优反应。本发明检测方法快速准确,与普通RT-PCR相比,灵敏度高出100倍,特异性强,无需昂贵器材,只需恒温水浴锅即可完成,田间可操作性强,适合田间样品的快速检测,对烟田TMV病毒病的预防与治理有一定的指导作用。
搜索关键词: 一种 快速 检测 土壤 病残 携带 tmv 方法
【主权项】:
一种快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)提取土壤中病残体TMV总RNA;(2)以提取的总RNA为模板,逆转录得到cDNA;(3)以cDNA为模板,用以下两对引物进行LAMP扩增,得到扩增产物;第1对引物:TMV‑FIP5'‑GCTGTGACTAACGGATCTAATACCG‑AGGTTCCCTGACAGTGAC‑3'TMV‑BIP5'‑GAAGTTGAAAATCAGGCGAACCC‑TGCGTCGTCTACTCTACG‑3'第2对引物:TMV‑F3:5'‑GGAAACCTTCACCACAAGT‑3' TMV‑B3:5'‑TATAGCGCTCCTTATGGC‑3' (4)用TAE电泳缓冲液配制2%琼脂糖凝胶,取5μL LAMP扩增产物在水平电泳槽中进行电泳,110V/100mA电泳35min,得到目标TMV的瀑布离散型条带。
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