[发明专利]一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用有效
| 申请号： | 201511030627.2 | 申请日： | 2015-12-31 |
| 公开（公告）号： | CN105543352B | 公开（公告）日： | 2020-02-07 |
| 发明（设计）人： | 陈宏;蔡含芳;白跃宇;蓝贤勇;石涛;徐瑶;张良志;雷初朝 | 申请（专利权）人： | 西北农林科技大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6851 | 分类号： | C12Q1/6851;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 61200 西安通大专利代理有限责任公司 | 代理人： | 徐文权 |
| 地址： | 712100 陕*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以秦川牛基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照，最后利用2 | ||
| 搜索关键词： | 一种 检测 秦川 fgf13 基因 拷贝 变异 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法，其特征在于：包括以下步骤：以秦川牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时定量PCR扩增FGF13基因的拷贝数变异区域以及作为对照的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定秦川牛FGF13基因的拷贝数变异类型；具有插入型拷贝数变异类型的个体在生长性状上显著优于具有正常型拷贝数变异类型的个体；/n所述的FGF13基因的拷贝数变异区域位于FGF13基因参考基因组序列AC_000187.1的621003位至622778位；/n所述的拷贝数变异类型是根据-ΔΔCt将定量结果分为的三类：插入型，-ΔΔCt>0.5；缺失型，-ΔΔCt<-0.5；正常型，-0.5≤-ΔΔCt≤0.5；/n所述的引物对P1为：/n上游引物F1：5’-AAGAGGGTGTTTGCTAT-3’/n下游引物R1：5’-CAGTAACGCTGAAGAAG-3’；/n所述的引物对P2为：/n上游引物F2：5’-AACCAGGAGAAACTCGCCAA-3’/n下游引物R2：5’-TTCGGTGAAATGCCCTCTCG-3’。/n
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