[发明专利]测序方法

摘要

本发明涉及用于生成模板核酸分子的序列的方法，用于确定至少两个模板核酸分子的序列的方法，适于执行所述方法的计算机程序和用于存储所述计算机程序的计算机可读介质。具体地，本发明涉及用于生成至少一个个体靶模板核酸分子的序列的方法，包括：a)提供包含至少两个靶模板核酸分子的核酸分子的至少一个样品；b)将第一分子标记引入所述至少两个靶模板核酸分子中的每一个的一端，并将第二分子标记引入所述至少两个靶模板核酸分子中的每一个的另一端，以提供至少两个带标记模板核酸分子，其中每个带标记模板核酸分子是以独有的第一分子标记和独有的第二分子标记进行标记的；c)扩增所述至少两个带标记模板核酸分子，以提供所述至少两个带标记模板核酸分子的多个拷贝；d)对所述至少两个带标记模板核酸分子包括所述第一分子标记和所述第二分子标记的区域进行测序；和e)为所述至少两个靶模板核酸分子中的至少一个重建共有序列。

主权项

用于生成至少一个个体靶模板核酸分子的序列的方法，包括：a)提供包含至少两个靶模板核酸分子的核酸分子的至少一个样品；b)将第一分子标记引入所述至少两个靶模板核酸分子中的每一个的一端，并将第二分子标记引入所述至少两个靶模板核酸分子中的每一个的另一端，以提供至少两个带标记模板核酸分子，其中每个带标记模板核酸分子是以独有的第一分子标记和独有的第二分子标记进行标记的；c)扩增所述至少两个带标记模板核酸分子，以提供所述至少两个带标记模板核酸分子的多个拷贝；d)对所述至少两个带标记模板核酸分子的包括所述第一分子标记和第二分子标记的区域进行测序；和e)为所述至少两个靶模板核酸分子中的至少一个重建共有序列，其中步骤e)包括(i)通过将包含彼此同源的第一分子标记序列和彼此同源的第二分子标记序列的序列归类至同一簇，识别所述至少两个带标记模板核酸分子的多个拷贝中可能与相同靶模板核酸分子对应的区域的序列簇；(ii)选择至少一个序列簇，其中所选择的簇内的序列包含比与其他第一分子标记或第二分子标记共有度更高地彼此关联的第一分子标记和第二分子标记；(iii)通过对步骤(ii)中所选择的簇内的至少两个模板核酸分子的序列进行比对，并且定义这些序列的共有序列，来重建第一靶模板核酸分子的共有序列；和(iv)对于第二模板核酸分子和/或更多的模板核酸分子，执行步骤(ii)至(iii)。