[发明专利]用于使用基因表达数据去卷积混合细胞群的方法在审

专利信息
申请号: 201580054736.X 申请日: 2015-08-04
公开(公告)号: CN107109471A 公开(公告)日: 2017-08-29
发明(设计)人: P.J.达纳赫 申请(专利权)人: 纳米线科技公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C40B30/02;G06F19/20;G06F19/24
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司72001 代理人: 彭昶,罗文锋
地址: 美国华*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 通过mRNA序型分析鉴定体液可允许从法医样品提取前后“活性水平”信息。因此,本发明基于颜色编码的(例如,NanoString®)探针的溶液杂交,提供用于法医体液/组织鉴定的原型多路数字基因表达方法。例如,本发明提供来自单一体液的样品中基因表达的模型,并扩展至体液混合物。进行样品中体液量的最大似然估计的计算,并描述使用似然比检验样品中每一体液的存在情况。本发明描述了一种方法/算法,并且,不像常规用于检测组织和细胞的算法,其可允许横跨多个样品零假阳性流体鉴定。这样的方案可促进mRNA序型分析在先前不如此可靠的社会工作(例如,法医)实验室中常规使用。
搜索关键词: 用于 使用 基因 表达 数据 卷积 混合 细胞 方法
【主权项】:
用于法医生物样品鉴定的方法,包括:获取用于分析的至少一种生物样品;从生物样品提取总RNA;在至少一个测定中将所述总RNA与至少一个探针杂交;和使用多路代码集分析所述至少一个测定,其中分析包括:测定一组基因以在样品中定量;通过产生基因集中的每一基因的基因表达对数函数建模基因集中每一基因的基因表达;基于基因集中每一基因的建模基因表达产生所述生物样品中生物物质的量的最大似然估计。
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