[发明专利]用于病毒感染的鉴定和区分的系统和方法在审
| 申请号： | 201580068630.5 | 申请日： | 2015-11-20 |
| 公开（公告）号： | CN107429302A | 公开（公告）日： | 2017-12-01 |
| 发明（设计）人： | S·拉比扎德;K·尼亚齐;S·C·本茨;A·阮 | 申请（专利权）人： | 南托米克斯有限责任公司 |
| 主分类号： | C12Q1/70 | 分类号： | C12Q1/70;C12Q1/68;G06F19/10 |
| 代理公司： | 余姚德盛专利代理事务所(普通合伙)33239 | 代理人： | 郑洪成 |
| 地址： | 美国加*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明提供了测定用于区分至少2种非特定的病原体的引物的系统和方法，其中所述的病原体属于不同的病原体(例如病毒)科，该病原体科包含多种不同的病原体物种和/或品种。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 病毒感染 鉴定 区分 系统 方法 | ||
【主权项】：
一种获得用于区分2种非特定的病原体的引物集的方法，所述的非特定的病原体的每一种均属于不同的病毒科，并且其中各个病毒科包含多种不同的病毒物种和血清型，所述的方法包括：对于多种病毒物种的基因组和各个不同的病毒科的血清型而言，进行各个多重序列比对，从而产生对于各个所述的不同的病毒科的比对结果；在各个比对结合中鉴定各个共有序列，该共有序列具有：(i)高于最低阈值的同源性，(ii)高于最低阈值的长度，以及(iii)高于最低阈值的熔融温度；对于所述的不同的病毒科，将所鉴定的共有序列收集至各个调节的比对结果中；对于所述的各个调节的比对结果，消除与人类和人类宿主序列具有最低同源性的序列，由此形成各个病毒特异性比对结果；对所述的病毒特异性比对结果进行差集分析，由此获得所述的非特定病原体的共有序列的各个集；以及由所述的共有序列的各个集选择引物序列。
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