[发明专利]猪3号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点及其引物

摘要

本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪3号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr3:59537592；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，扩增该位点的引物及延伸引物为：Chr3‑1‑PCRU：5’‑TTG GTC CTC AGT CAT GTG G‑3’；Chr3‑1‑PCRL：5’‑AAC CTC TTC CCT TGA CCT GA‑3’；Chr3‑1‑SNPU：5’‑TGA CTA GTA GGC AGG CAA GAA CAT TCA GAG‑3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于C/C基因型,T为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于：全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因，基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr3:59537592这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

主权项

1.一种检测猪3号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点的引物在检测猪产仔数中的应用，其特征在于：所述引物包括PCR扩增引物以及延伸引物，其中PCR扩增引物的核苷酸序列如下所示：hr3‑1‑PCRU：5’‑TTGGTCCTCAGTCATGTGG‑3’；Chr3‑1‑PCRL：5’‑AACCTCTTCCCTTGACCTGA‑3’；延伸引物的核苷酸序列如下所示：Chr3‑1‑SNPU：5’‑TGACTAGTAGGCAGGCAAGAACATTCAGAG‑3’，所述猪为白色杜洛克×二花脸猪杂交资源群F2代母猪，所述SNP位点为基因组版本NCBI Sscrofal10.2的Chr3:59537592,该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，带有T/C基因型的猪产仔数高于带有C/C和T/T基因型的猪，其中基因型T/C为提高猪产仔数的有益基因型。