[发明专利]一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统有效

专利信息
申请号: 201610049964.4 申请日: 2016-01-25
公开(公告)号: CN105760708B 公开(公告)日: 2018-12-14
发明(设计)人: 周家锐;纪震;殷夫;朱泽轩 申请(专利权)人: 哈尔滨工业大学深圳研究生院
主分类号: G06F19/12 分类号: G06F19/12
代理公司: 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 代理人: 王永文;刘文求
地址: 518055 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统。本发明不依赖于真实实验,可通过修改参数设定,大量产生所需的代谢混合物MS/MS仿真质谱,其成本极低,样本量不受采集条件限制。此外,当条件与环境变动时,也无需重新设计并进行实验;有助于提升代谢组学的研发效率。本发明使用非线性回归模型生成MS/MS仿真质谱,避免了传统算法中简单线性叠加所带来的准确性问题。此外,通过统计真实代谢质谱数据建立噪声概率模型,涵盖了现实应用中需要面临的复杂干扰情况。所生成的质谱数据更符合实际,可有效指导代谢组学的前期研发,并部分用于算法性能的验证。
搜索关键词: 一种 代谢 混合物 ms 仿真 生成 方法 系统
【主权项】:
1.一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法,其特征在于,包括步骤:A、设所需仿真的混合物质内包含N种代谢物所述N种代谢物的真实MS/MS质谱对应为S={S1,S2,…Sn…,SN},其中任意Sn=[(m1,i1),(m2,i2),…(md,id),…],md、id分别为第d条谱线的质核比与强度值;B、根据每个代谢物的真实MS/MS质谱,统计每个代谢物的噪声概率模型;C、根据每一代谢物的噪声概率模型生成Φ中相应代谢物的仿真质谱组;D、根据所有代谢物的仿真质谱组,依次产生代谢混合物MS/MS仿真质谱;E、设置最大生成仿真数量为L,将每次产生的代谢混合物MS/MS仿真质谱组成S*={S*1,S*2,…,S*L},并作为生成结果输出;所述步骤B具体包括:B1、设当前输入为第n个代谢物的真实MS/MS质谱Sn,Sn=[(m1,i1),(m2,i2),…(md,id),…],提取其质核比矢量为M=[m1,m2,…],强度矢量为I=[i1,i2,…];B2、对于M中的每个质核比数值,取其小数部分,形成质核偏移矢量T=[t1,t2,…];B3、计算T的均值为μT,方差为σT,从而构造质核比概率模型为正态分布N(μT,σT);B4、计算I的均值为μI,方差为σI,构造强度概率模型为正态分布N(μI,σI);B5、从而得到第n个代谢物的噪声概率模型为Pn=[N(μT,σT),N(μI,σI)];所述步骤D具体包括:D1、从每个代谢物的仿真质谱组S*n,n=1,2,…,N中,各随机选择一个质谱S*n,K,k∈K,共计N个;将其中所有谱线混合,组成新的质谱矢量Sl=[(m1′,i1′),(m2′,i2′),…];D2、提取Sl的质核比矢量为Ml,计算其质核比概率模型为Nl(μT′,σT′);D3、使用回归算法对Sl进行建模形成非线性模型Rl;D4、对于Ml中的每个md′,使其产生一个服从Nl(μT′,σT′)分布的随机偏移值t′:m*d′=md′+t′,并使用Rl计算对应的强度值为i*d′,构成新的仿真谱线(m*d′,i*d′),将所有仿真谱线组成代谢混合物MS/MS仿真质谱S*l=[(m*1,i*1),(m*2,i*2),…],作为当前输出;D5、更新计数器l=l+1,若l
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