[发明专利]一种基于高通量测序的微生物群落组成的方法和装置

摘要

本发明公开一种基于16S rRNA基因高可变区V1/V2的微生物群落组成的方法和装置。该方法包括提取微生物样品中的DNA，对样品中DNA的16S rRNA的高可变区V1/V2分别进行进行PCR扩增；对扩增产物进行Solexa建库，同时在建库过程中通过加上带有标签序列的接头，对每个样品进行标记；将带有标签序列的不同样品进行混合，混合后使用Solexa测序工具进行测序，得到按照标签区分的原始的测序序列读长(reads)；利用读长的重叠关系组装得到高可变区V1/V2或V6的全长序列全长序列(unique reads)；对全长读长进行序列相似度的比较分析，以实现对样品中微生物的分类及相对丰度的计算。本发明的方法和装置，对微生物群落的组成分析准确。

主权项

一种对微生物16S rRNA基因高可变区V1/V2进行高通量测序聚类分析的方法，其特征在于，该方法包括：提取微生物样品中的脱氧核糖核酸(DNA)；对提取DNA的宏基因组16S核糖体核糖核酸(rRNA)的高可变区V6进行扩增，得到作为扩增产物的DNA片段；对DNA片段进行PCR‑Free Solexa建库，建库过程中在DNA片段上加上标签序列以对每个样品进行标记；将各个样品的带有标签序列的DNA片段进行混合，使用Solexa测序工具对混合后的DNA片段进行测序，得到按照标签区分的测序读长(reads)；利用测序序列的重叠关系组装得到高可变区V6的全长序列(unique reads)；对全长序列进行分类分析，以实现对微生物群体的分类。