[发明专利]一种真核生物DNA的Hi‑C高通量测序建库方法有效

专利信息
申请号: 201610309577.X 申请日: 2016-05-11
公开(公告)号: CN105839196B 公开(公告)日: 2018-04-17
发明(设计)人: 郑洪坤;刘慧;宋军;郭艳 申请(专利权)人: 北京百迈客生物科技有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/6869
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司11002 代理人: 王文君
地址: 101300 北京市顺*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明涉及一种真核生物DNA的Hi‑C高通量测序建库方法,其中,DNA细胞核内环化步骤包括将末端修复后DNA与环化体系混合并在4‑6℃孵育2‑4h后在16‑22℃下孵育4‑6h获得内环化后物料;其中,所述环化体系的组成成分包括T4连接酶缓冲液、BSA、T4 DNA连接酶以及选自PEG 4000和PEG 6000中的至少一种的聚乙二醇。本发明所提供的方法能够有效的提高DNA的特性环化效率,获得明显高于传统方法的有效数据率。
搜索关键词: 一种 生物 dna hi 通量 测序建库 方法
【主权项】:
一种真核生物DNA的Hi‑C高通量测序建库方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:首先对样品进行甲醛交联获得交联后的物料,对所述交联后物料进行内切酶酶切获得酶切后物料,用生物素标记的碱基对所述酶切后物料进行末端修复,获得末端修复后DNA,对所述末端修复后DNA进行DNA细胞核内环化获得内环化后物料,再对所述内环化后物料进行解交联和纯化获得DNA测序文库;其中,DNA细胞核内环化步骤包括将末端修复后DNA与环化体系混合并在4‑6℃孵育2‑4h后在16‑22℃下孵育4‑6h获得内环化后物料;其中,所述环化体系的组成成分包括:T4连接酶缓冲液、BSA、T4DNA连接酶以及选自PEG 4000和PEG 6000中的至少一种的聚乙二醇。
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