[发明专利]一种基于高通量测序的基因芯片探针序列的获取方法在审
| 申请号： | 201610585938.3 | 申请日： | 2016-07-23 |
| 公开（公告）号： | CN107653299A | 公开（公告）日： | 2018-02-02 |
| 发明（设计）人： | 夏云;文兴澈 | 申请（专利权）人： | 成都十洲科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6811 | 分类号： | C12Q1/6811 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 610000 四川*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | 本发明涉及生物技术领域，具体来说是一种基于高通量测序的基因芯片探针序列的获取方法，步骤包括(1)确定待测基因片段；(2)待测未知物种高通量测序；(3)高通量检测拼接；(4)利用已知物种基因做blast比对；(5)基因芯片探针设计。本发明可以明显的加速获取待检的未知物种相应基因片段，弥补了常规PCR有时无法有效扩增的缺陷，同时，比对找出的旁系同源基因或非特异性相似片段可增加背景信息，有效的减少非特异性探针杂交，从而减少假阳性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 通量 基因芯片 探针 序列 获取 方法 | ||
【主权项】：
一种基于高通量测序的基因芯片探针序列的获取方法，其特征在于，步骤包括：(1)确定待测基因片段：根据已有的资料，评估出用于特定检测项目所需的基因芯片目标基因片段；(2)待测未知物种高通量测序：对需要检测但不具有该基因的物种或样品进行高通量测序，根据检测的目的可以采用不同的高通量测序方案；(3)高通量检测拼接：高通量测序后整理，采用相关的软件进行拼接，生成contig文件，用于后续的比对分析；(4)利用已知物种基因做blast比对：用已知的物种该段基因，在拼接生成的contig文件做比对，直接钓出未知该基因；(5)基因芯片探针设计：根据所搜集的不同物种的该基因序列设计长度为18‑40bp探针。
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