[发明专利]一种基于微流控芯片的人Y-STR基因位点分型方法有效

专利信息
申请号: 201611065191.5 申请日: 2016-11-28
公开(公告)号: CN108118088B 公开(公告)日: 2021-08-27
发明(设计)人: 秦建华;苏文涛;姜雷;李艳峰 申请(专利权)人: 中国科学院大连化学物理研究所
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858
代理公司: 沈阳晨创科技专利代理有限责任公司 21001 代理人: 郑虹
地址: 116023 *** 国省代码: 辽宁;21
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摘要: 发明公开了一种基于微流控芯片的人Y‑STR基因位点分型方法,涉及DNA分析领域。该方法包括选择缓冲体系、选择电泳芯片、Y染色体STR位点选择、电泳等步骤。本发明基于芯片电泳技术结合激光诱导荧光检测系统,在12分钟内分离了5个人Y染色体上的STR基因座(DYS459、DYS446、DYS443、DYS460和Y‑GATA‑A10),并完成真实血液样本的Y‑染色体STR分型测试。芯片电泳对Y‑染色体STR分型所表现出来的高分辨、快速的分离分析能力,使它有希望成为快速、简便、高效分离检测人类染色体STR位点的分析手段之一。
搜索关键词: 一种 基于 微流控 芯片 str 基因 位点分型 方法
【主权项】:
一种基于微流控芯片的Y染色体STR位点分型方法,其特征在于:包括下列步骤:(1)选择电泳体系:进样缓冲液体系由50mmol/L三羟甲基氨基甲烷、50mmol/L N‑三(羟甲基)甲基‑3‑氨基丙烷磺酸、1mmmol/L乙二胺四乙酸组成1×TTE缓冲液,pH8.0‑9.0;样本分离体系由POP 4或POP 7胶组成;(2)选择电泳芯片:芯片包括样品池、样品废液池、缓冲液池、缓冲液废液池及十字管道;所述十字管道的横臂左右两端分别向垂直方向延伸,并分别与缓冲液废液池及缓冲液池相通,十字管道的纵臂上端与样品池相通,十字管道的纵臂下端与通过U形延伸段后与样品废液池相通;在十字管道的交叉处与缓冲液废液池之间的横臂上设置检测点;(3)芯片表面修饰:首先将芯片置于真空干燥器中抽真空约10分钟;取出芯片,立即向单个池中加入1M NaOH 65℃保持15min,抽干NaOH,加入1M HCl,室温保持15min,抽干后加入0.25%聚N‑羟乙基丙烯酰胺(pHEA),室温保持1小时,最后以乙腈抽干微通道置于室温备用;(4)Y染色体STR位点选择:基于中国人群中基因多态性(GD>0.6)和等位基因跨度的考虑,我们选择了其中的五个中国人群多态性大,等位基因跨度较小的五个Y染色体基因座作为研究对象;这五个Y染色体基因座位点分别是DYS459、DYS446、DYS443、DYS460和Y‑GATA‑A10;(5)电泳:用1×TTE缓冲液浸洗2分钟;样品废液池、缓冲液池和缓冲液废液池加入缓冲液后,样品池中注入待测样本;样品废液池、缓冲液池和缓冲液废液池加入缓冲液后,样品池中注入待测样本;进样阶段,样品池0V,样品废液池+500‑800V,缓冲液池+0‑200V,缓冲液废液池+300‑800V,进样5‑60秒后切换电压进入分离阶段;分离时,缓冲液废液池+3000‑4000V,缓冲液池0V,样品池和样品废液池均施加+500‑1100V,运行温度为25℃;;得到血清样本中五个Y染色体基因座位点的出峰时间、相对含量数据。
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