[发明专利]一种改造芽孢杆菌基因组的方法有效

专利信息
申请号: 201611081187.8 申请日: 2016-11-30
公开(公告)号: CN106755046B 公开(公告)日: 2019-09-20
发明(设计)人: 任钧;唐旭;曹镜;雷蕾;樊超;柴进凯;曹富明;孙楠;范佳 申请(专利权)人: 成都美溢德生物技术有限公司
主分类号: C12N15/75 分类号: C12N15/75;C12N15/74;C12R1/125;C12R1/10;C12R1/07;C12R1/46;C12R1/01
代理公司: 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 代理人: 易小艺
地址: 610222 四川省*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明属于生物技术领域,具体涉及一种改造芽孢杆菌基因组的方法。本发明具有适应性广(质粒转化难度低,pBTS质粒可以在多种革兰氏阳性菌中进行复制,改造多种菌的基因组),可以反复多次改造同一菌株(重组质粒具有两个同源重组片段,依次发生两次同源重组,第二次同源重组后可能恢复到野生型,也可以得到改造菌株,但是不残留任何影响继续改造的片段,如抗性标记、质粒复制元件等),并且可以改造对细菌生长影响较大的基因(引入cre重组酶和第二种抗性标记系统,可依靠抗性筛选第二次重组得到的改造菌株,杀死生存能力强的野生型菌株,之后表达cre重组酶,切割掉第二种抗性标记,残留的片段不会影响再次对菌株进行改造)。
搜索关键词: 改造 菌株 抗性标记 同源重组 芽孢杆菌基因组 残留 革兰氏阳性菌 生物技术领域 野生型菌株 抗性筛选 生存能力 细菌生长 质粒复制 质粒转化 重组质粒 基因组 野生型 质粒 切割 杀死 复制 基因 引入 恢复
【主权项】:
1.一种改造芽孢杆菌基因组的方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)在pBAV1K‑T5‑GFP质粒的EcoR I和Apa I位点插入多克隆位点片段,并且通过同义突变,删除其中的NdeI酶切位点,得质粒pBTS;所述pBTS核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;(2)在多克隆位点的左端的酶切位点插入500‑800bp的同源重组片段A,右侧酶切位点插入500‑800bp的同源重组片段B,中间插入突变片段、目的片段或不插入任何片段,既两个同源重组区域之间需要改造的片段,得质粒pBTS‑X;(3)通过电转化将pBTS‑X转入芽孢杆菌中,得阳性转化菌株;(4)挑取(3)中的阳性转化菌落进入液体培养基中进行培养,培养温度为45℃,培养时间大于24h;(5)取步骤(4)中菌液100ul—500ul,涂布到含30mg/L卡那霉素的LB平板上,培养温度为45℃,进行过夜培养;(6)挑取步骤(5)中的菌落进入液体培养基中进行培养,每8—16h传代一次,直到筛选到无抗菌株;(7)取步骤(6)中的菌液进行稀释涂板,稀释105‑106倍,过夜培养;(8)挑取步骤(7)中的菌落进行抗性鉴定,直到获得5‑10株无抗菌株;(9)将无抗菌株接种到液体培养基中,过夜培养,抽提细菌基因组,进行PCR鉴定;阳性菌株继续进行测序鉴定,测序鉴定结果为阳性菌株即得芽孢杆菌菌株。
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