[发明专利]一种鉴定木薯块根肉质颜色的分子标记方法有效

专利信息
申请号: 201611199010.8 申请日: 2016-12-22
公开(公告)号: CN106755405B 公开(公告)日: 2019-11-01
发明(设计)人: 严华兵;周慧文;谢向誉;曹升;尚小红;陈新;陆柳英;曾文丹 申请(专利权)人: 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858
代理公司: 重庆为信知识产权代理事务所(普通合伙) 50216 代理人: 刘旭章
地址: 530011 广西壮族自治区南宁市(里建*** 国省代码: 广西;45
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摘要: 发明公开了一种鉴定木薯块根肉质颜色的分子标记方法,该方法采用CTAB法从木薯叶片中提取木薯基因组DNA,设计一对特异引物扩增包含PSY2基因SNP2位点的260bp核苷酸序列,然后对木薯基因组DNA进行PCR扩增,利用限制性内切酶AluI酶切PCR扩增产物,使用浓度为3.0%琼脂糖凝胶对酶切产物进行电泳分离,然后根据电泳结果进行木薯材料的块根颜色判定。本发明可用于木薯块根肉质颜色的分子标记辅助育种,可实现在苗期时通过抽提叶片DNA进行分子标记分析检测,进而准确鉴别木薯块根肉质颜色,能快速选择符合育种目标的块根肉质颜色材料进行大田移栽,从而提高育种效率,加快育种进程。
搜索关键词: 肉质 木薯块根 木薯 块根 基因组DNA 分子标记 种鉴定 分子标记辅助育种 分子标记分析 限制性内切酶 核苷酸序列 琼脂糖凝胶 大田移栽 电泳分离 电泳结果 快速选择 酶切产物 特异引物 颜色材料 颜色判定 育种进程 育种目标 育种效率 叶片DNA 抽提 可用 扩增 酶切 位点 叶片 鉴别 检测
【主权项】:
1.一种鉴定木薯块根肉质颜色的分子标记方法,其特征在于,由以下步骤组成:(1)采用CTAB法从木薯叶片中提取木薯基因组DNA,根据PSY2基因的DNA序列,设计一对特异引物可以扩增包含SNP2位点的260bp核苷酸序列,然后用该特异引物对木薯基因组DNA进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;(2)利用限制性内切酶AluI酶切步骤(1)得到的PCR扩增产物,获得酶切产物;(3)使用浓度为3.0%琼脂糖凝胶对步骤(2)的酶切产物进行电泳分离,然后根据电泳结果进行木薯材料的块根肉质颜色判定,块根肉质颜色判定标准为:若电泳后可见2条带——194bp和66bp,或电泳后见1条带——194bp,则该木薯材料的块根肉质颜色为黄色;若电泳后可见2条带——172bp和66bp,或电泳后见1条带——172bp,则该木薯材料的块根肉质颜色为白色;若是电泳后可见3条带——194bp、172bp和66bp,或电泳后见2条带——194bp和172bp,则该木薯材料的块根肉质颜色为浅黄色;在步骤(1),所述特异引物核苷酸序列为:上游引物:5’GCTTCACACATAACGCCAACA‑3’;下游引物:5’TGGCTGAAACAGATGTTCAAAGG‑3’。
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