[发明专利]一种一管反应式的DNA分子克隆拼接方法有效
申请号: | 201611255752.8 | 申请日: | 2016-12-30 |
公开(公告)号: | CN106591294B | 公开(公告)日: | 2019-05-17 |
发明(设计)人: | 陆勇军;阿迪亚 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12P19/34 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 单香杰 |
地址: | 510006 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种一管反应式的DNA分子克隆拼接或改造方法,将目标DNA片段、桥接引物、多聚核苷酸激酶、热稳定性连接酶和反应缓冲液混合形成反应体系,缓冲液含有ATP、NAD+和Mg2+,pH值为6~10,通过一个热循环过程完成,本发明实现了在一管内一次性完成连接反应,且大大提高了连接反应效率,还具有以下优点:(1)DNA片段的磷酸化和拼接步骤在一管中一步完成连接反应,避免了使用磷酸化引物造成的高昂成本;(2)DNA片段无缝连接,不引入多余核苷酸;(3)非DNA序列依赖;(4)被拼接的DNA片段末端不引入其它核苷酸,DNA片段可重用于其他构建工作;(5)价格低廉,较常规的酶切连接方法成本低廉。 | ||
搜索关键词: | 拼接 连接反应 反应式 核苷酸 克隆 目标DNA片段 多聚核苷酸 反应缓冲液 磷酸化引物 一次性完成 过程完成 热稳定性 无缝连接 一步完成 激酶 常规的 缓冲液 连接酶 磷酸化 热循环 引入 构建 管内 接引 酶切 改造 | ||
【主权项】:
1.一种一管反应式的DNA分子克隆拼接或改造方法,其特征在于,将目标DNA片段、桥接引物、多聚核苷酸激酶、热稳定性DNA连接酶和反应缓冲液混合形成反应体系,将所述反应体系进行热循环反应获得完整连接产物,所述桥接引物的一段序列与一条目标DNA片段的磷酸化5’端互补配对退火,桥接引物的剩余一段序列与另一条目标DNA片段的去磷酸化3’端互补配对退火;所述多聚核苷酸激酶对单链或双链目标DNA片段的5’末端进行磷酸化,对3’末端进行去磷酸化;所述热稳定性DNA连接酶是对含有缺刻处的双链DNA的缺刻处进行连接;所述反应缓冲液含有ATP、NAD+和Mg2+;所述缓冲液的pH值为6~10;所述目标DNA片段与桥接引物的摩尔浓度比为1:0.1~100;所述热循环包括以下条件:80~105℃,0~2min高温变性、30~80℃,0~2min退火、30~80℃,0~10min延伸,循环数为1~60;所述ATP的浓度小于等于20mM、NAD+的浓度小于等于20mM,Mg2+的浓度小于等于100mM。
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