[发明专利]用于测定胃肠道菌群失调的方法有效
| 申请号： | 201680018149.X | 申请日： | 2016-03-24 |
| 公开（公告）号： | CN107430644B | 公开（公告）日： | 2021-11-19 |
| 发明（设计）人： | T·林道尔;M·卡尔松;M·塞克尔加;F·海格 | 申请（专利权）人： | 遗传分析股份有限公司 |
| 主分类号： | G16H50/20 | 分类号： | G16H50/20 |
| 代理公司： | 北京信诺创成知识产权代理有限公司 11728 | 代理人： | 尹吉伟 |
| 地址： | 挪威*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明提供一种用于测定个体的胃肠道菌群失调的可能性的方法，所述方法包含提供测试数据集，其中所述测试数据集包含至少一个微生物群分布，所述微生物群分布为来自所述个体的胃肠道的样品中的多种微生物或微生物群组的相对水平的分布且其中每一微生物或微生物群组的每一水平为所述测试数据集的分布元素，向所述测试数据集应用由来自多个正常个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的水平分布内的潜在变量测定的至少一个负荷矢量，从而产生第一投影数据集，向所述第一投影数据集应用所述至少一个负荷矢量的转置版本，从而产生第二投影数据集，将所述测试数据集与所述第二投影数据集进行比较且组合第二投影数据集与所述测试数据集的对应分布元素之间的差值，且将组合差值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，向所述第一投影数据集应用至少一个本征值，所述本征值由所述至少一个负荷矢量测定，且组合每一分布元素的所得值且将组合值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，其中具有超过所述各别菌群正常到菌群失调阈值的所述组合差值或所述组合所得值的微生物群分布说明菌群失调的可能性。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 测定 胃肠道 失调 方法 | ||
【主权项】：
一种用于测定个体的胃肠道菌群失调的可能性的方法，所述方法包含：(i)提供测试数据集，其中所述测试数据集包含至少一个微生物群分布，所述微生物群分布为来自所述个体的胃肠道的样品中的多种微生物或微生物群组的相对水平的分布且其中每一微生物或微生物群组的每一水平为所述测试数据集的分布元素，(ii)向所述测试数据集应用由来自多个正常个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的水平分布内的潜在变量测定的至少一个负荷矢量，从而产生第一投影数据集，(iii)向所述第一投影数据集应用所述至少一个负荷矢量的转置版本，从而产生第二投影数据集，(iv)将所述测试数据集与所述第二投影数据集进行比较且组合所述第二投影数据集与所述测试数据集的对应分布元素之间的差值，且将组合差值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，(v)向所述第一投影数据集应用至少一个本征值，所述本征值由所述至少一个负荷矢量测定，且组合每一分布元素的所得值且将组合值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，其中步骤(v)可在步骤(iii)或(iv)中的任一个之前或之后或同时进行，且其中具有超过所述各别菌群正常到菌群失调阈值的所述组合差值或所述组合所得值的微生物群分布说明菌群失调的可能性。
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