[发明专利]病毒组捕获测序平台、设计和构建方法以及使用方法

摘要

本发明提供用于同时检测、鉴定和/或表征已知或疑似感染脊椎动物的所有病毒的新颖方法、系统、工具以及试剂盒。本文所描述的所述方法、系统、工具以及试剂盒是基于病毒组捕获测序平台(“VirCapSeq‑VERT”)，所述平台是由本发明人开发的一种新颖平台。本发明还提供用于设计和构建所述病毒组捕获测序平台的方法和试剂盒。

主权项

一种设计和/或构建病毒组捕获测序平台的方法，所述病毒组捕获测序平台包含用于同时检测、鉴定和/或表征已知或疑似感染脊椎动物的所有病毒的寡核苷酸，所述方法包括：a.获得表1中所列病毒分类群中的每一种中的至少一种病毒的基因组的核苷酸序列；b.从步骤a中获得的所述核苷酸序列提取编码序列，其中选择以80％同一性群集的编码序列进行提取；以及c.将所述编码序列分解成片段，其中所述片段的长度为50至100个核苷酸，具有约90％序列同一性，并且以特定间隔平铺在所述编码序列上，以获得序列信息，从而设计选择性杂交至感染或疑似感染脊椎动物的所有病毒的基因组的寡核苷酸。