[发明专利]合成DNA部件、途径和基因组的平行功能性检测在审
申请号: | 201680066174.5 | 申请日: | 2016-11-18 |
公开(公告)号: | CN108291256A | 公开(公告)日: | 2018-07-17 |
发明(设计)人: | B·克里斯滕;M·克里斯滕 | 申请(专利权)人: | 苏黎世联邦理工学院 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12N15/10 |
代理公司: | 北京三友知识产权代理有限公司 11127 | 代理人: | 庞东成;张培源 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
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摘要: | 本发明涉及一种确定人工遗传元件的功能性的方法。将设计为起到与天然遗传元件相同的生物学功能的人工遗传元件引入细胞,并使所述细胞经受高频转座子诱变条件。随后,从所述细胞获得代表转座元件的插入位点的DNA序列组,并确定转座元件在天然遗传元件和人工遗传元件中的插入频率。对转座子插入频率进行比较,从而可以对所述人工功能性元件指定功能性可能性,如果转座子插入频率对于两种元件基本相等则该功能性可能性高,而如果转座子在人工遗传元件中的插入频率更高则该功能性可能性低。 | ||
搜索关键词: | 遗传元件 转座元件 转座子 细胞 功能性检测 功能性元件 生物学功能 转座子诱变 插入位点 合成DNA 基因组 对转 座子 相等 平行 引入 | ||
【主权项】:
1.一种确定人工遗传元件的功能性的方法,其中该方法包括以下步骤:a)提供第一批多个细胞,其中所述细胞包括对于所述细胞的繁殖所必需的天然遗传元件;b)在转基因步骤中,在所述多个细胞内引入人工遗传元件,该人工遗传元件据预期或经设计以起到与所述天然遗传元件相同的生物学功能;c)使所述多个细胞在诱变步骤中经受高频转座子诱变条件,其中转座元件可以插入到所述天然遗传元件和/或所述人工遗传元件中,并在之后d)获得DNA序列组,其中每个序列代表来自所述多个细胞的所述转座元件的插入位点;和e)确定所述转座元件在以下两种元件中的插入频率:‑所述天然遗传元件,和‑所述人工遗传元件,f)比较所述天然遗传元件中的转座子插入频率与所述人工遗传元件中的转座子插入频率,并g)指定所述人工功能性元件的功能性可能性,即,‑如果转座子插入频率对于两种元件基本相等,则该功能性可能性高,而‑如果转座子插入在人工遗传元件中的频率更高,则该功能性可能性低。
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