[发明专利]全基因组数字扩增的方法在审

专利信息
申请号: 201680090529.4 申请日: 2016-08-31
公开(公告)号: CN109923214A 公开(公告)日: 2019-06-21
发明(设计)人: X·S·谢;邢栋;张棋涵 申请(专利权)人: 哈佛学院董事及会员团体
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 余颖;钱文宇
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 本公开提供了一种用于基因组DNA扩增的方法,如全基因组扩增,包括使用转座酶系统制造包含引物结合位点的基因组DNA的片段,在油中分离在其自身水性微滴内的各片段以及PCR扩增试剂,扩增在其自身水性微滴内的各片段,使微滴反乳化以获得扩增子,并对扩增子进行测序。
搜索关键词: 扩增 微滴 基因组DNA 全基因组 扩增子 引物结合位点 系统制造 转座酶 测序 乳化
【主权项】:
1.一种基因组核酸扩增的方法,其包括:将基因组DNA与多个转座酶与转座子DNA结合二聚体接触,其中所述转座子DNA包含转座酶结合位点,任选的条码序列和引物结合位点,其中所述多个二聚体结合沿着双链核酸分布的靶位置,而所述转座酶将所述基因组DNA切割成多个双链基因组DNA片段,所述基因组DNA片段代表基因组DNA片段文库,其中各双链基因组DNA片段具有与所述双链基因组DNA片段各5'末端结合的所述转座子DNA,对所述转座子DNA和所述基因组DNA片段之间的缺口进行缺口填平,以形成各末端具有引物结合位点的双链基因组DNA片段延伸产物的文库,在油相内产生多个水性液滴的亚组,其中所述亚组的各水性液滴包含所述文库的单个双链基因组DNA片段延伸产物和扩增试剂,对于所述亚组的各水性液滴,在其中扩增所述双链基因组DNA片段以在所述水性液滴内产生所述双链基因组DNA片段的扩增子,其中扩增在所述亚组的所有液滴中发生,和由所述亚组的水性液滴收集所述扩增子。
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