[发明专利]一种用于利用肿瘤FFPE样本检测体细胞突变的装置在审
申请号: | 201710067031.2 | 申请日: | 2017-02-07 |
公开(公告)号: | CN106874710A | 公开(公告)日: | 2017-06-20 |
发明(设计)人: | 陈玥茏;侯光远;刘卉;陈玉洁;王旺;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 | 申请(专利权)人: | 安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100176 北京市大兴区经济技*** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明涉及一种用于利用肿瘤FFPE样本检测体细胞突变的装置,其包括数据获取模块、突变频率统计模块、对比模块、判定模块以及检测结果输出模块。本发明的用于利用肿瘤FFPE样本检测体细胞突变的装置能够更准确地将系统错误与真实的体细胞突变进行区分,不仅提高了灵敏度,而且降低了假阳性与假阴性。 | ||
搜索关键词: | 一种 用于 利用 肿瘤 ffpe 样本 检测 体细胞 突变 装置 | ||
【主权项】:
一种用于利用肿瘤FFPE样本检测体细胞突变的装置,其包括:数据获取模块,用于获取肿瘤FFPE样本DNA的测序数据及健康人群DNA的测序数据,所述测序数据包括所述肿瘤FFPE样本DNA各位点的突变频率、以及与所述肿瘤FFPE样本DNA各位点对应的健康人群中的每个个体的DNA各位点的突变频率;突变频率统计模块,其与所述数据获取模块相连接,用于统计所述健康人群群体的所述DNA各位点中的每一个位点的突变频率分布情况,得到健康人群突变频率统计模型;对比模块,其与所述数据获取模块及所述突变频率统计模块相连接,用于将所述肿瘤FFPE样本DNA各位点的突变频率与所述健康人群突变频率统计模型进行对比,获得对比结果;判定模块,其与所述对比模块相连接,用于判定所述肿瘤FFPE样本DNA各位点的突变是否为真实的体细胞突变,获得判定结果;其中,当所述对比结果为有显著差异、且突变频率小于设定值时,判定结果为真实的体细胞突变;以及检测结果输出模块,其与所述判定模块相连接,用于输出所述判定模块的所述判定结果。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于安诺优达基因科技(北京)有限公司,未经安诺优达基因科技(北京)有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201710067031.2/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用