[发明专利]一种核酸第三代测序原始数据的处理方法及其应用有效
| 申请号： | 201710150622.6 | 申请日： | 2017-03-14 |
| 公开（公告）号： | CN108573127B | 公开（公告）日： | 2021-04-27 |
| 发明（设计）人： | 刘亚斌;邓天全;贺丽娟;杨林峰;高强 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 彭家恩;罗瑶 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本申请公开了一种核酸第三代测序原始数据的处理方法及其应用。本申请的核酸第三代测序原始数据的处理方法，包括将第二代短序列数据比对到第三代自纠错数据上，统计比对结果中第三代自纠错数据的单碱基覆盖深度，将单碱基覆盖深度低于阈值的区域屏蔽为N，采用第二代测序的补洞软件对N屏蔽区域进行补洞，以获得单碱基错误率较低的核酸第三代测序数据。本申请的核酸第三代测序原始数据的处理方法，利用第二代短序列数据与第三代长序列数据进行比对，并利用第二代测序的补洞软件对比对结果中单碱基覆盖深度较低的N屏蔽区进行补齐，有效的降低了第三代测序数据中的单碱基错误率，提高了测序质量。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 核酸 第三代 原始数据 处理 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种核酸第三代测序原始数据的处理方法，其特征在于：包括将第二代短序列数据比对到第三代自纠错数据上，统计比对结果中第三代自纠错数据的单碱基覆盖深度，将单碱基覆盖深度低于阈值的区域屏蔽为N，采用第二代测序的补洞软件对N屏蔽区域进行补洞，以获得单碱基错误率较低的核酸第三代测序数据。
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