[发明专利]基于表型分析的眼部生理信息的基因组分析方法和装置在审
申请号: | 201710153482.8 | 申请日: | 2017-03-15 |
公开(公告)号: | CN108629148A | 公开(公告)日: | 2018-10-09 |
发明(设计)人: | 蓝章彰;杨传春;许详阳;陈川;张文勇 | 申请(专利权)人: | 深圳市乐土精准医疗科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18;G06F19/22;G06F19/24;G06F19/28 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 孙银行;彭愿洁 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明公开了一种基于表型分析的眼部生理信息的基因组分析方法和装置。本发明的方法包括:获取给定表型信息以及与眼部生理信息相关的注释基因组信息,获取等位基因频率数据库、突变预测数据库、人类遗传变异数据库和人类表型数据库中的数据;计算变异位点分值;计算与给定表型信息相关的眼部生理信息的相关系数;计算变异位点分值和相关系数的加权数值,并依据加权数值获得最相关的眼部生理信息。本发明的方法能够自动化筛选出与给定表型符合的候选基因以及变异位点,并根据相关性评分,获得最可能与给定表型相关的眼部生理信息。 | ||
搜索关键词: | 生理信息 眼部 表型 变异位点 数据库 方法和装置 基因组分析 表型分析 加权 等位基因频率 基因组信息 候选基因 人类遗传 信息相关 突变 自动化 筛选 预测 | ||
【主权项】:
1.一种基于表型分析的眼部生理信息的基因组分析方法,其特征在于,包括:获取给定表型信息以及与所述眼部生理信息相关的注释基因组信息,所述注释基因组信息包含变异位点信息,获取等位基因频率数据库、突变预测数据库、人类遗传变异数据库和人类表型数据库中的数据;依据所述变异位点信息、所述等位基因频率数据库、突变预测数据库、人类遗传变异数据库中的数据,计算变异位点分值;依据所述给定表型信息和所述人类表型数据库中的数据,计算与所述给定表型信息相关的眼部生理信息的相关系数;计算所述变异位点分值和所述相关系数的加权数值,并依据所述加权数值获得最相关的眼部生理信息。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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