[发明专利]高通量测序数据的平行比较分析有效
| 申请号： | 201710190109.X | 申请日： | 2011-12-20 |
| 公开（公告）号： | CN106971089B | 公开（公告）日： | 2020-12-04 |
| 发明（设计）人： | J·Z·森波;D·豪斯勒 | 申请（专利权）人： | 加利福尼亚大学董事会 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B20/20;G16B50/30 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 赵蓉民;王永伟 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明涉及高通量测序数据的平行比较分析。通过利用相对于参考基因组序列的子串的已知位置递增地同步序列串，在子串的比对基础上构成差异序列对象。然后生成输出文件，其包含关于仅参考基因组的相关变化。 | ||
| 搜索关键词： | 通量 序数 平行 比较 分析 | ||
【主权项】：
一种基因组差异序列分析系统，包括：存储患者肿瘤的肿瘤基因组序列和患者健康组织的种系基因组序列的序列数据库；和序列分析引擎，其与序列数据库连接并且包括存储软件指令的有形的、非临时性的计算机可读存储器和至少一个处理器，其中在执行软件指令时，处理器可配置：以从所述序列数据库获得表示至少部分的肿瘤基因组序列的肿瘤串和表示至少部分的种系基因组序列的种系串，其中所述肿瘤串和所述种系串彼此重叠在至少一个基因组位置处；以产生局部差异串，其包括在至少一个重叠基因组位置处的所述肿瘤串和所述种系串之间的差异，其中所述局部差异串包含蛋白质编码序列；和以在差异序列数据库中，基于所述局部差异串更新差异序列对象，其中所述差异序列对象与所述患者相关联。
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