[发明专利]一套适用于鉴定啤酒花品种及纯度的SNP位点及其应用

摘要

本发明公开了一套适用于鉴定啤酒花品种及纯度的SNP位点，共包括5个啤酒花SNP位点。本发明基于对10个国内外具有代表性的啤酒花品种的全基因组测序结果，对全基因组的SNP位点进行比对筛选，目前验证了多态性较好的5个SNP位点进行啤酒花品种及纯度的鉴定，该5个SNP位点能够对啤酒花品种进行鉴别，并且基因分型结果稳定，待后续的SNP位点真实性验证工作完成后将补全啤酒花SNP位点指纹数据库。本发明提供的SNP位点及鉴定方法，为啤酒生产行业提供了一种低成本、高效率、标准化的啤酒花品种及纯度鉴定体系。

主权项

本发明筛选出的啤酒花基因组中的5个SNP位点，其特征在于，可在如下应用中使用：啤酒花品种基因分型；构建啤酒花SNP位点指纹数据库；啤酒花样品纯度定量鉴定；啤酒花样品混杂品种定性鉴定；所述5个SNP位点如下：SNP位点1为NCBI上提交的Contig LD161349.1的第9970位核苷酸，具体所在序列如下：GCCACCTACAACAATTCAAGGTGCCAGAAGGACACTTGGATCTCAGCGAACCAGGTCCTGAGGGCGCCCACATAAGAATATCAGCCACTCTGTCAGGAAAACAACTCCT(A/C)GTATGCAGTTGCTATTTGGAGGGCAAACACCCCAAGTTGAACTACAACGAGTTAATCAGATAGCTCGGGAAAACAGAGACGGACTCCCTTCTAATCCGAC；SNP位点2为NCBI上提交的Contig LD205009.1的第1776位核苷酸，具体所在序列如下：CTCGTGGAGAGTGAGACCACGCGGTTCTAAGAACACGCGCCTGTGCTCCCAACAAATCCCCAATTACTCGGAATTCGTGTGTCAGGAGGGTCAGGTTAGAATTTT(G/T)CCTTGGAGGGAAAGTTCCAATAGGCAAGAAAGGCAAAACCGCCTGTGAAGCGTGTCCCCTAAGCTACCTGGTTTTGGACCCAAAATACTGGAAA；SNP位点3为NCBI上提交的Contig LD169680.1 的第2676位核苷酸，具体所在序列如下：GTCAGGAGTTCTCAGATTACAGCTGCAAGAAGAAAGGACAGGTAAGAGAAGAATTGATCTGAAGCCGCAA AGAAGCTAATGAAGAGCGTCTGAAG(A/G)ATTGAAAGCATAACAAGACTGGTAAGCGCGTCATCTATTGCACAAGCACCTCCGGAGACGACTACATCAGAGATGAGAAGAACAGCAAAACTTG；SNP位点4为NCBI上提交的Contig LD167190.1 的16972位核苷酸，具体所在序列如下:TCCCGCAAGGTTCGACCCATCCTCGCGCCAGATGCGCCTGGGCGTGCACAATCCGTGACGCACTCCCACAAGTCCATGTCCTCATCATAGA(T/C)CACGTCCTTTATGCCACCACTCTTAACTTAACCATAACACACATATATTCCAGCATCATCAGATGTCAATCAATTCTTACCTTGTCTTCTGAATTTCT；SNP位点5为NCBI上提交的Contig LD201072.1的2650位核苷酸，具体所在序列如下：GATATTACCAGTTCGCTGACATCTATCACAGGCCTTGACAAAAACATTAGCATCCTTGAATAATGAAGGCCAATAGAAACCACTTTGTAATACCTTGGC(T/C)GCCGTTCTTGATGCTCCAAAGTGCCCACCACATTGTTGAGTGTGACAATGGTTGAGAATTGACTGCATCTCTTCTTCAGGAACACACCTTCTGATAATCT。