[发明专利]一种同时检测黄牛FoxO1基因两个插入缺失位点的方法及其应用

摘要

本发明公开了一种同时检测黄牛FoxO1基因两个插入缺失位点的方法及其应用。该检测方法以待测黄牛全基因组DNA为模板，通过Touch‑down PCR程序同时扩增黄牛FoxO1基因第二内含子区插入缺失位点，根据琼脂糖凝胶电泳结果，同时鉴定黄牛FoxO1基因存在的2个插入缺失位点(Indel3：rs383545622；Indel4：rs525318770)的基因型。本发明提供的检测方法为FoxO1基因的2个Indel位点多态性与中国黄牛生长性状关系的建立奠定了基础，以便FoxO1基因的两个插入缺失突变可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

主权项

1.一种同时检测黄牛FoxO1基因两个插入缺失位点的方法，其特征在于：包括以下步骤：以黄牛的基因组DNA为模板，以引物对E3和E4为引物，通过一次Touch‑down PCR程序扩增FoxO1基因上两个Indel位点：Indel3和Indel4，其中Indel3是rs383545622，Indel4是rs525318770，将两个Indel位点所对应的扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测，根据电泳结果同时分型鉴别黄牛个体存在的两个与生长性状显著关联的Indel位点的基因型；所述的引物对E3为：上游引物Indel3‑F：5’‑CGCCCTCAAATCTGTGGTGT‑3’下游引物Indel3‑R：5’‑TGCTTGCCAGGACAAGGTTA‑3’所述的引物对E4为：上游引物Indel4‑F：5’‑TATTACAGCGCAGCTTGGGAT‑3’下游引物Indel4‑R：5’‑TTCAGTGAGCTCAGGCATTCA‑3’。