[发明专利]基于DNA的融合基因定量测序建库、检测方法及其应用有效
| 申请号： | 201710389183.4 | 申请日： | 2017-05-27 |
| 公开（公告）号： | CN107699957B | 公开（公告）日： | 2021-07-23 |
| 发明（设计）人： | 王晨;王冠;戴春;朱沁;许强 | 申请（专利权）人： | 领星生物科技（上海）有限公司;上海领安生物科技有限公司;启东领星医学检验实验室有限公司 |
| 主分类号： | C40B50/06 | 分类号： | C40B50/06;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司： | 上海市汇业律师事务所 31325 | 代理人： | 陆红杰 |
| 地址： | 201203 上海市浦东区自由贸*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于DNA的融合基因定量测序建库方法，步骤包括：1)基因组DNA片段化；2)DNA片段分选；3)单向特异性PCR扩增，获得带融合位点的扩增产物；4)在扩增产物序列的3’端连接单链通用文库接头序列；5)通用PCR扩增，富集融合基因区域片段，经纯化、定量，获得测序文库。本发明还公开了通过上述方法构建DNA文库进行融合基因测序检测的方法、该方法的用途，以及用于上述建库方法的融合基因单向特异性引物组。本发明通过单向特异性扩增DNA片段，捕获融合序列，再通过富集获得NGS测序用DNA文库，不仅提高了捕获的有效数据的比例，而且加快了建库和检测的速度，适合用于FFPE样本或液态活检。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 dna 融合 基因 定量 测序建库 检测 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
基于DNA的融合基因定量测序建库方法，其特征在于，包括以下步骤：1)样本基因组DNA片段化，并对片段化产物进行纯化；2)对纯化后的DNA片段进行分选，获取所需长度的DNA片段；3)对分选所得DNA片段进行单向特异性PCR扩增，获得带有融合位点的扩增产物，对该扩增产物进行纯化；4)在步骤3)所得扩增产物的序列的3’端上连接单链的通用文库接头序列，并对连接产物进行纯化；5)进行通用PCR扩增，富集融合基因区域片段，并对扩增产物进行纯化、定量，获得融合基因测序DNA文库。
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