[发明专利]一种配对互作基因检测方法及预测模型

摘要

本发明公开了一种配对互作基因检测方法及预测模型，检测方法包括以下步骤对给定的数据集{Yi,Xij}，首先对每个基因表达值进行秩规格化，得到规格化后的数据矩阵{Yi,Rij}，即对于任一基因j，将其表达值按从小到大顺序排列，然后用每个表达值的排列位置代替初始表达值；对任意两个基因p和基因q采用abs模式进行转换，获得转换后的数据集{Yi,Zis}；abs模式Zis＝|Rip–Riq|；其中i＝1,2,…,n；p＝1,2,…,m；q＝1,2,…,m；p≠q；s＝1,2,…,m(m‑1)/2；n为数据集中的样本数，m为数据集中的基因数；计算每个变量Zis与表型Yi之间的t值，根据t值判断两个基因之间的互作效应。本发明可有效提高模型预测精度。

主权项

一种配对互作基因检测方法，其特征在于，包括以下步骤：1)对给定的数据集{Yi,Xij}，首先对每个基因表达值进行秩规格化，得到规格化后的数据矩阵{Yi,Rij}；2)对任意两个基因p和基因q采用abs模式进行转换，获得转换后的数据集{Yi,Zis}；abs模式:Zis＝|Rip–Riq|；其中i＝1,2,…,n；p＝1,2,…,m；q＝1,2,…,m；p≠q；s＝1,2,…,m(m‑1)/2；n为数据集中的样本数，m为数据集中的基因数；Rip表示第i个样本的第p个基因排秩转换后的表达值；Riq表示第i个样本的第q个基因排秩转换后的表达值；3)基于t测验方法计算每个变量Zis与表型Yi之间的t值，根据t值对应的概率值p值判断两个基因之间的互作效应。