[发明专利]基因组数据存储方法及电子设备有效
申请号: | 201710546293.7 | 申请日: | 2017-07-06 |
公开(公告)号: | CN107480466B | 公开(公告)日: | 2020-08-11 |
发明(设计)人: | 蔡文君;何光铸;王东辉;孔令雪 | 申请(专利权)人: | 北京荣之联科技股份有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B30/00;G16B40/00;G06F3/06 |
代理公司: | 北京风雅颂专利代理有限公司 11403 | 代理人: | 李莎;李弘 |
地址: | 100080 北京市海淀区北四*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种基因组数据存储方法,包括:在基因组比对过程中,得到基因序列比对信息,并创建基因序列统计信息;将所述基因序列比对信息存储于磁盘,并按基因序列比对信息在基因组的比对位置,在内存中存储相应的索引;所述索引为所述基因序列比对信息在磁盘中的存储位置;对所述基因组统计信息进行分类,得到第一统计信息和第二统计信息;将第一统计信息存储于内存,所述第一统计信息为变异检测过程中访问频率高于预设频率的统计信息;将第二统计信息存储于磁盘,所述第二统计信息为无法存储于内存的统计信息和/或变异检测过程中访问频率低于预设频率的统计信息。本发明还公开了一种采用所述基因组数据存储方法的电子设备。 | ||
搜索关键词: | 基因组 数据 存储 方法 电子设备 | ||
【主权项】:
一种基因组数据存储方法,其特征在于,包括:在比对过程中,得到基因序列比对信息,并创建基因序列统计信息;将所述基因序列比对信息存储于磁盘,并按基因序列比对信息在基因组的比对位置,在内存中存储相应的索引;所述索引为所述基因序列比对信息在磁盘中的存储位置;对所述基因组统计信息进行分类,得到第一统计信息和第二统计信息;将第一统计信息存储于内存,所述第一统计信息为变异检测过程中访问频率高于预设频率的统计信息;将第二统计信息存储于磁盘,所述第二统计信息为无法存储于内存的统计信息和/或变异检测过程中访问频率低于预设频率的统计信息。
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