[发明专利]肺炎致病菌快速识别基因芯片

摘要

本发明公开了一种肺炎致病菌快速识别的基因芯片。该基因芯片可以检测肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎支原体、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、洋葱伯克霍尔德菌、嗜肺军团菌、肺炎衣原体15种致病菌，其中包括了临床常见的和难培养的肺炎致病菌。在其制备过程中，采用了每种肺炎致病菌所对应的16S rDNA和特异基因序列进行探针的设计、筛选和验证，分别从“属”和“种”的级别同时对待检测样品中细菌的种类进行鉴定。本发明芯片弥补了目前临床肺炎致病菌检测不及时不全面的缺陷，为肺炎患者早诊断、早治疗提供了一种新的检测手段。

主权项

一种肺炎致病菌快速识别基因芯片，其中，所述肺炎致病菌包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎支原体、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、洋葱伯克霍尔德菌、嗜肺军团菌、肺炎衣原体中的至少一种；所述基因芯片上包括至少一个探针，用于与待检样品进行杂交；所述至少一个探针中的每个探针对应于所述肺炎致病菌中的至少一种；所述至少一个探针包括至少一个第一探针；一个所述第一探针对应于所述肺炎致病菌中的一种病菌；所述第一探针用于鉴定与其对应的所述的肺炎致病菌的特异基因，由此确定被测细菌的种；其中，用于鉴定所述肺炎链球菌的第一探针的序列为：CAAAGTAGTACCAAGTGCCATTGATTTTCTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述金黄色葡萄球菌的第一探针的序列为：CAAAGAACTGATAAATATGGACGTGGCTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述流感嗜血杆菌的第一探针的序列为：GAACGTGGTACACCAGAATACAACATCGCTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述肺炎支原体的第一探针的序列为：TGAGGTGAATGGGTTGTTGAATCCGTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述铜绿假单胞菌的第一探针的序列为：TTGTGCCTGCTCGACCCGCTGGACGGGGTCTACAACTACCTCGCCCAGTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述鲍曼不动杆菌的第一探针的序列为：TCGATCCACGTGCTAAAGTGATTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述粪肠球菌的第一探针的序列为：TTACATGGGCCAAATGGTGAAGATGGAACATTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述屎肠球菌的第一探针的序列为：TCCTTTTTCCGTCATCAGTATAAAGTATAGTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述肺炎克雷伯杆菌的第一探针的序列为：AAAGCCGGCGTGTACGATAATTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述大肠埃希菌的第一探针的序列为：CGCCAAATCCGCAACGTAATGACAGTGTACCAACCCTTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述阴沟肠杆菌的第一探针的序列为：GCAGGCGATCTGTACGTTCAGGTTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述嗜麦芽窄食单胞菌的第一探针的序列为：TACCACCCGTACCTGGACTTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述洋葱伯克霍尔德菌的第一探针的序列为：TGGTGCGCTCGGGCTCGATCGACATTTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述嗜肺军团菌的第一探针的序列为：ATAGCATTGGTGCCGATTTGGGGAAGAATTTTTTTTTTTT；用于鉴定所述肺炎衣原体中的第一探针的序列为：ACTGCCGTAGATAGACCTAACCCGGCCTATTTTTTTTTTTT。