[发明专利]植物内生细菌多样性16SrDNA扩增子制备方法在审
| 申请号： | 201710568923.0 | 申请日： | 2017-07-13 |
| 公开（公告）号： | CN107312847A | 公开（公告）日： | 2017-11-03 |
| 发明（设计）人： | 樊济才;陈龙;张璐璐;高楠;胡秋萍 | 申请（专利权）人： | 上海美吉生物医药科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12N15/10 |
| 代理公司： | 上海恒锐佳知识产权代理事务所(普通合伙)31286 | 代理人： | 黄海霞 |
| 地址： | 201321 上海*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明提供了一套用于高通量测序的引物，所述引物由针对植物内生细菌16S rDNA V5～V7可变区片段的引物对799F/1193R和连接在所述引物对799F/1193R的5'端的Barcode序列组成，其中，所述799F的序列为SEQ ID NO1，所述1193R的序列为SEQ ID NO4，与所述799F的5'端连接的Barcode序列选自SEQ ID NO5‑28中的序列，与所述1193R的5'端连接的Barcode序列选自SEQ ID NO29‑52中的序列。本发明通过两轮的巢式PCR特异地扩增植物内生细菌16S rDNA V5～V7可变区，获得5'端带有Barcode序列的适用于目前二代高通量测序平台的扩增子。采用本发明提供的方法进行植物内生细菌多样性研究，可显著提高植物内生细菌16S rDNA的扩增效率，极大地减少测序数据中宿主数据的占比，降低研究成本。 | ||
| 搜索关键词： | 植物 细菌 多样性 16 srdna 扩增 制备 方法 | ||
【主权项】：
用于高通量测序的的引物，其特征在于，所述引物由针对植物内生细菌16S rDNA V5～V7可变区片段的引物对799F/1193R和连接在所述引物对799F/1193R的5'端的Barcode序列组成，其中，所述799F的序列为SEQ ID NO：1，所述1193R的序列为SEQ ID NO：4，与所述799F的5'端连接的Barcode序列选自SEQ ID NO：5‑28中的序列，与所述1193R的5'端连接的Barcode序列选自SEQ ID NO：29‑52中的序列。
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