[发明专利]膀胱癌组织T细胞图谱模型及其构建方法和构建系统在审
申请号: | 201710576974.8 | 申请日: | 2017-07-14 |
公开(公告)号: | CN109251980A | 公开(公告)日: | 2019-01-22 |
发明(设计)人: | 眭维国;戴勇;马井生;薛雯 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军第一八一医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/10 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
地址: | 530000 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 一种膀胱癌组织T细胞图谱模型及其构建方法和构建系统,其中构建方法包括如下步骤:设置疾病组与对照组,其中,疾病组取膀胱癌患者膀胱癌组织的标本待用,对照组取膀胱癌患者膀胱癌旁组织的标本待用;提取各标本的全基因组DNA;扩增出TCR的CDR3区,分别得到疾病组文库和对照组文库;采用高通量测序技术,对所述疾病组文库和所述对照组文库进行测序;对测序结果进行分析,构建膀胱癌组织T细胞图谱模型。上述膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法,通过膀胱癌组织和癌旁组织免疫组库测序分析TCR数量的变化,能发现那些高克隆扩增TCR CDR3序列,可间接获知这些高克隆扩增T细胞亚家族的分布特点,从而有利于进一步研究膀胱癌发生发展机制。 | ||
搜索关键词: | 膀胱癌 构建 图谱模型 文库 扩增 疾病 构建系统 测序 标本 克隆 高通量测序技术 全基因组DNA 测序分析 分布特点 组织免疫 获知 分析 发现 研究 | ||
【主权项】:
1.一种膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:设置疾病组与对照组,其中,疾病组取离体的膀胱癌患者膀胱癌组织的标本待用,对照组取离体的膀胱癌患者膀胱癌旁组织的标本待用;提取各标本的全基因组DNA;扩增出TCR的CDR3区,分别得到疾病组文库和对照组文库;采用高通量测序技术,对所述疾病组文库和所述对照组文库进行测序;对测序结果进行分析,构建膀胱癌组织T细胞图谱模型。
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