[发明专利]一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用有效

专利信息
申请号: 201710619782.0 申请日: 2017-07-26
公开(公告)号: CN107287326B 公开(公告)日: 2018-02-16
发明(设计)人: 饶秋;夏秋媛;方茹;叶胜兵;李芳秋;周晓军 申请(专利权)人: 中国人民解放军南京军区南京总医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司32218 代理人: 傅婷婷,夏平
地址: 210002 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用。Xp11.2的新易位伴侣为FUBP1‑TFE3基因易位,FUBP1基因位于1p31.1,共22个外显子;基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间;优选包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。一种检测FUBP1‑TFE3易位性肿瘤的PCR引物,上游引物FUBP1‑E17‑F序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物TFE3‑E2‑R序列如SEQ ID NO.2所示。本发明针对高通量测序发现的新融合位点设计了特异性的PCR引物,扩大了原引物组合的检测范围,应用于临床,可提高诊断该类肿瘤的检出率和准确率。
搜索关键词: 一种 xp11 易位 伴侣 fubp1 及其 检测 引物 应用
【主权项】:
一种融合基因,其特征在于为FUBP1‑TFE3基因易位,FUBP1基因位于1号染色体,位置77944055‑77979494,序列来自GeneBank,序列版本号GRCh38.p7,共22个外显子;基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间;所述的融合基因包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
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