[发明专利]一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用有效
申请号: | 201710619782.0 | 申请日: | 2017-07-26 |
公开(公告)号: | CN107287326B | 公开(公告)日: | 2018-02-16 |
发明(设计)人: | 饶秋;夏秋媛;方茹;叶胜兵;李芳秋;周晓军 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军南京军区南京总医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司32218 | 代理人: | 傅婷婷,夏平 |
地址: | 210002 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用。Xp11.2的新易位伴侣为FUBP1‑TFE3基因易位,FUBP1基因位于1p31.1,共22个外显子;基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间;优选包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。一种检测FUBP1‑TFE3易位性肿瘤的PCR引物,上游引物FUBP1‑E17‑F序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物TFE3‑E2‑R序列如SEQ ID NO.2所示。本发明针对高通量测序发现的新融合位点设计了特异性的PCR引物,扩大了原引物组合的检测范围,应用于临床,可提高诊断该类肿瘤的检出率和准确率。 | ||
搜索关键词: | 一种 xp11 易位 伴侣 fubp1 及其 检测 引物 应用 | ||
【主权项】:
一种融合基因,其特征在于为FUBP1‑TFE3基因易位,FUBP1基因位于1号染色体,位置77944055‑77979494,序列来自GeneBank,序列版本号GRCh38.p7,共22个外显子;基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间;所述的融合基因包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
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