[发明专利]检测核酸差异的探针形式

摘要

本发明涉及检测核酸差异的探针形式。本发明尤其提供了用于检测靶核酸序列的存在或不存在的新探针、方法、反应混合物和试剂盒。

主权项

包含锚定物核酸结构域和报道物核酸结构域的可检测标记的探针在制备用于检测生物学样品中靶核酸序列的存在或不存在的方法中的试剂盒中的用途，所述方法包括：a. 使所述包含锚定物核酸结构域和报道物核酸结构域的可检测标记的探针与所述样品接触；和b. 检测所述探针与所述靶核酸的结合的存在或不存在，其中所述锚定物结构域和报道物结构域小于50%互补并通过非核苷接头连接，所述非核苷接头是六甘醇，并且所述锚定物结构域或报道物结构域在不存在所述靶核酸的情况下都不形成茎环；和其中（i）所述探针是不可通过聚合酶延伸的；（ii）所述接头在所述锚定物结构域的3'末端的2个核苷酸内与所述锚定物结构域连接，并且所述接头在所述报道物结构域的5'末端的2个核苷酸内与所述报道物结构域连接，其中所述锚定物结构域不与可检测标记连接，并且所述报道物结构域包含一个或多个稳定碱基，从而使得在报道物结构域和可能靶序列之间的解链温度中的差异得到强调；（iii）所述锚定物结构域和所述报道物结构域各自包含与所述靶核酸的相同链互补的至少6个核苷酸的邻接序列；和/或（iv）在所述锚定物结构域和所述靶核酸之间的杂交本身足以驱动所述探针在所述靶核酸的预期位置上的杂交。